Protein–RNA interactions for Protein: O35714

Tnfrsf18, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 18, mousemouse

Predictions only

Length 228 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf18O35714 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Adgrl1-201ENSMUST00000045393 5643 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Farp2-201ENSMUST00000120301 3937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Washc1-201ENSMUST00000072383 2904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Rpl34-ps2-201ENSMUST00000081679 354 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Sesn1-202ENSMUST00000099931 3809 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Nr3c2-203ENSMUST00000109912 5675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Tmem116-204ENSMUST00000111795 2221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Miox-201ENSMUST00000023282 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Mis12-201ENSMUST00000048807 3003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Irf3-202ENSMUST00000107834 1429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Kdm3a-201ENSMUST00000065509 4816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 G0s2-201ENSMUST00000009777 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Mfng-201ENSMUST00000018313 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Kif21a-205ENSMUST00000109288 6142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
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Tnfrsf18O35714 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Tnfrsf18O35714 Prdm4-201ENSMUST00000037646 3877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
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