Protein–RNA interactions for Protein: O35599

Opn1mw, Medium-wave-sensitive opsin 1, mousemouse

Predictions only

Length 359 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Opn1mwO35599 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Zdhhc2-201ENSMUST00000049389 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Nap1l1-208ENSMUST00000219961 1512 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Jade2-201ENSMUST00000020655 6273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Znfx1-201ENSMUST00000048988 7218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Kit-204ENSMUST00000144270 5241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Wscd1-203ENSMUST00000108511 2866 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Noc4l-201ENSMUST00000042147 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mrps18c-201ENSMUST00000016977 638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cyba-201ENSMUST00000017604 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 2610008E11Rik-204ENSMUST00000220220 799 ntTSL 2 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm32351-201ENSMUST00000220503 438 ntTSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Wdr41-205ENSMUST00000160801 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Wdr41-201ENSMUST00000056512 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Foxp4-203ENSMUST00000113263 3156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm11696-201ENSMUST00000070956 2765 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Dancr-204ENSMUST00000132389 2347 ntBASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Rab3a-204ENSMUST00000110093 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Spsb1-203ENSMUST00000105685 1537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.82□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 P2rx4-201ENSMUST00000031429 2702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Poglut1-201ENSMUST00000036210 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ebf1-203ENSMUST00000109268 2864 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Map6-207ENSMUST00000208924 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Apip-201ENSMUST00000011055 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Pttg1ip-205ENSMUST00000162429 652 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm20412-201ENSMUST00000173249 633 ntTSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm27838-201ENSMUST00000184829 128 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Bet1l-209ENSMUST00000211624 769 ntTSL 3 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm7653-201ENSMUST00000214567 508 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Zswim7-201ENSMUST00000072916 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ranbp9-201ENSMUST00000144326 3371 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cyp21a2-ps-201ENSMUST00000172970 1383 ntBASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 A4galt-202ENSMUST00000164614 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Rasgrp1-207ENSMUST00000178884 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Pdhb-201ENSMUST00000022268 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Spryd4-201ENSMUST00000061995 1583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Rtp2-201ENSMUST00000061030 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.81□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Wscd2-201ENSMUST00000094452 4302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Kctd12-202ENSMUST00000184744 6057 ntAPPRIS P1 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cdca7l-201ENSMUST00000021592 2957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Nfkbid-201ENSMUST00000046177 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Hnrnph1-202ENSMUST00000077817 2126 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Aste1-202ENSMUST00000123807 2349 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Sgsm2-201ENSMUST00000057631 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 1010001B22Rik-201ENSMUST00000181488 589 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm26808-201ENSMUST00000181569 411 ntTSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Smim22-206ENSMUST00000184256 381 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Cript-201ENSMUST00000024959 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Alkbh6-201ENSMUST00000060834 982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Flvcr1-201ENSMUST00000085635 4040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ifnar1-202ENSMUST00000117748 2771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm3365-201ENSMUST00000216296 1480 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Arhgef10l-201ENSMUST00000039204 4493 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Ccdc160-201ENSMUST00000101588 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Sacs-204ENSMUST00000121091 4581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mepce-201ENSMUST00000031740 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Kat8-201ENSMUST00000033070 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Mydgf-201ENSMUST00000019723 1710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Hace1-201ENSMUST00000037044 3785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Exo5-204ENSMUST00000177880 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Exo5-201ENSMUST00000030375 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC14.8□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Tnxb-202ENSMUST00000168533 9381 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gldc-201ENSMUST00000025778 3754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Rgs19-203ENSMUST00000108771 1110 ntTSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Rgs19-205ENSMUST00000108776 1216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Gm8334-201ENSMUST00000112755 1662 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Opn1mwO35599 Asic4-202ENSMUST00000113577 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.79□□□□□ -0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.9 ms