Protein–RNA interactions for Protein: O35488

Slc27a2, Very long-chain acyl-CoA synthetase, mousemouse

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Length 620 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc27a2O35488 Pgbd5-201ENSMUST00000052580 2824 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ilf2-201ENSMUST00000001042 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Sh2b1-205ENSMUST00000205733 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Spint2-202ENSMUST00000108236 1211 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tppp3-202ENSMUST00000176419 719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mrpl28-201ENSMUST00000025014 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Znhit1-202ENSMUST00000085941 740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Map6-204ENSMUST00000127492 4920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Iffo1-201ENSMUST00000117675 2833 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mapk1ip1-203ENSMUST00000119664 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cacna1g-201ENSMUST00000021234 8139 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gpr137c-201ENSMUST00000146150 3917 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 AC167013.2-201ENSMUST00000228520 2684 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Asah1-201ENSMUST00000034000 2773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 B3gnt4-201ENSMUST00000031384 1423 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Psmd14-201ENSMUST00000028278 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Nupr1l-201ENSMUST00000178355 1827 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Dtx3-201ENSMUST00000038217 1944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tap2-201ENSMUST00000025197 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ncs1-201ENSMUST00000000199 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Acaa1b-201ENSMUST00000010795 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Prdm5-201ENSMUST00000031973 1488 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ccnd3-ps-201ENSMUST00000117963 881 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm29501-201ENSMUST00000186133 530 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Atp2a2-202ENSMUST00000177974 3984 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tmem184a-201ENSMUST00000044002 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Dnajc9-201ENSMUST00000022345 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Slc22a15-207ENSMUST00000190824 3010 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Nsd3-207ENSMUST00000143445 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ano7-201ENSMUST00000058682 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Igsf8-204ENSMUST00000139528 2866 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Hist1h2be-202ENSMUST00000091704 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm27867-201ENSMUST00000184778 125 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm7506-201ENSMUST00000207758 815 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Ccnj-201ENSMUST00000025983 3819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Gm43205-201ENSMUST00000198622 1968 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Col4a2-201ENSMUST00000033899 6450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Tgif2-202ENSMUST00000081335 2900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Mdfic-203ENSMUST00000125326 3635 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Raet1e-204ENSMUST00000181645 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cpeb3-212ENSMUST00000154376 5671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Cand2-201ENSMUST00000075995 5474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Pja1-205ENSMUST00000167246 2666 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Slc27a2O35488 Smarce1-201ENSMUST00000103133 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
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