Protein–RNA interactions for Protein: O35451

Atf6b, Cyclic AMP-dependent transcription factor ATF-6 beta, mousemouse

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Length 699 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atf6bO35451 Nkain4-202ENSMUST00000108873 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Fam174b-201ENSMUST00000107456 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm26547-201ENSMUST00000181186 1508 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 1700029H14Rik-203ENSMUST00000134023 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Nfasc-208ENSMUST00000188307 3049 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Akap7-203ENSMUST00000100012 2321 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm16675-202ENSMUST00000208508 2586 ntTSL 2 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Poli-201ENSMUST00000043286 2591 ntTSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cilp2-201ENSMUST00000057831 4314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Leng8-201ENSMUST00000037472 5105 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Trp53rkb-203ENSMUST00000151826 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.06□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Fam174a-202ENSMUST00000186780 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Stat3-207ENSMUST00000138438 2506 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Csad-201ENSMUST00000023805 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Wnk1-223ENSMUST00000177761 11303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Sf1-204ENSMUST00000113489 2863 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Derl1-201ENSMUST00000022993 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Pias3-201ENSMUST00000064900 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ndufs7-202ENSMUST00000105364 983 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Dusp13-208ENSMUST00000183698 1019 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm5253-201ENSMUST00000187104 1025 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm9682-201ENSMUST00000197505 556 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm6443-201ENSMUST00000203599 874 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm18206-201ENSMUST00000207027 926 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm45669-201ENSMUST00000209808 459 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gsdmcl1-201ENSMUST00000071847 1133 ntTSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm26702-201ENSMUST00000181730 4570 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ccny-201ENSMUST00000053917 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ccdc166-201ENSMUST00000182172 2584 ntBASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cand1-201ENSMUST00000020315 7766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.05□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ss18l1-201ENSMUST00000041126 4343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Rusc1-202ENSMUST00000090929 3706 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Prrg3-203ENSMUST00000170096 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
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Atf6bO35451 Per3-201ENSMUST00000103204 5999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Brd7-201ENSMUST00000034085 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ccnj-203ENSMUST00000120057 3783 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Tmpo-201ENSMUST00000020123 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Celf3-201ENSMUST00000029784 2744 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Egfl7-216ENSMUST00000174211 1163 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Gm7787-201ENSMUST00000216858 688 ntBASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Hist1h3c-201ENSMUST00000091752 630 ntAPPRIS P1 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Usp33-202ENSMUST00000117492 3886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ssu2-201ENSMUST00000060847 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Sned1-201ENSMUST00000062202 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Emx2-201ENSMUST00000062216 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Fam241b-204ENSMUST00000125704 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Pde4d-207ENSMUST00000120664 4207 ntTSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Tsc2-217ENSMUST00000227745 5598 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Rarb-201ENSMUST00000063750 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Ankrd24-201ENSMUST00000119336 3561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.04□□□□□ -0.32
Atf6bO35451 Plod2-203ENSMUST00000160359 3663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.03□□□□□ -0.32
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