Protein–RNA interactions for Protein: O35449

Prrt1, Proline-rich transmembrane protein 1, mousemouse

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Length 306 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prrt1O35449 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Cgn-201ENSMUST00000107272 4963 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pik3cd-204ENSMUST00000105690 4921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Hells-201ENSMUST00000025965 5868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Phtf2-201ENSMUST00000118174 4840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Bcl11b-201ENSMUST00000066060 8111 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Fut11-201ENSMUST00000048016 4163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Med22-202ENSMUST00000102899 3506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Tnfaip8-208ENSMUST00000148989 1002 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Gm10505-201ENSMUST00000151398 1587 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Reep4-201ENSMUST00000047218 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Sh2b2-201ENSMUST00000005188 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Kcng1-202ENSMUST00000109191 4089 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.37
Prrt1O35449 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Map3k9-202ENSMUST00000222322 3303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Dimt1-201ENSMUST00000022203 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ccdc27-201ENSMUST00000047207 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.71□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Kmt2e-202ENSMUST00000115128 7317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Pomt2-201ENSMUST00000037788 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ncbp2-201ENSMUST00000023460 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Nfatc1-202ENSMUST00000078049 4607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Cenps-202ENSMUST00000105695 544 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Sftpb-201ENSMUST00000070437 1131 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Smo-201ENSMUST00000001812 3779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tle3-215ENSMUST00000162583 4299 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tsc22d4-203ENSMUST00000100540 2730 ntTSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gid4-201ENSMUST00000070681 4283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Slc2a6-201ENSMUST00000045702 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Klc2-203ENSMUST00000113728 2838 ntTSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Sgsm1-201ENSMUST00000048112 5161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Serinc5-201ENSMUST00000049488 5366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 2410002F23Rik-218ENSMUST00000188382 2301 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.7□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Wbp2-201ENSMUST00000074628 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Nr2e3-201ENSMUST00000034831 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Prkcsh-205ENSMUST00000216344 2228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Pth2r-201ENSMUST00000027083 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gad2-201ENSMUST00000028123 5744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Fhod3-201ENSMUST00000037097 5408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 2410004I01Rik-201ENSMUST00000138424 1187 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm30025-201ENSMUST00000218555 728 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Slc7a7-209ENSMUST00000226753 2126 ntAPPRIS P1 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm26781-201ENSMUST00000181385 1477 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 AU040320-202ENSMUST00000102607 4191 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Rap1gap-203ENSMUST00000105835 4140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm38391-201ENSMUST00000191720 4069 ntBASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Snai1-201ENSMUST00000052631 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Zfp319-201ENSMUST00000057717 7232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Ssbp2-201ENSMUST00000004094 3957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Igsf21-201ENSMUST00000039331 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.69□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Opa1-206ENSMUST00000160597 6230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm33195-201ENSMUST00000220827 2337 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Atp2b3-201ENSMUST00000033744 3894 ntTSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Asb18-201ENSMUST00000086882 3862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm10457-201ENSMUST00000222619 1906 ntTSL 2 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Gm26675-201ENSMUST00000181068 1525 ntTSL 5 BASIC12.68□□□□□ -0.38
Prrt1O35449 Uba3-201ENSMUST00000089287 2257 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.68□□□□□ -0.38
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