Protein–RNA interactions for Protein: O35445

Rnf5, E3 ubiquitin-protein ligase RNF5, mousemouse

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Length 180 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnf5O35445 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Wdr45b-201ENSMUST00000026173 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Psmd5-201ENSMUST00000028225 4397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Spsb3-201ENSMUST00000024976 1947 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.94□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Fdps-203ENSMUST00000196709 1382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Desi2-201ENSMUST00000027783 8802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Tpt1-201ENSMUST00000110894 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zfp747-202ENSMUST00000205832 618 ntTSL 3 BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Miga1-202ENSMUST00000073089 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Bin2-207ENSMUST00000183211 2036 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm9768-201ENSMUST00000206007 2861 ntBASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.93□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ehd4-201ENSMUST00000028755 3730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Rgl2-201ENSMUST00000047503 3252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Tmem143-203ENSMUST00000209350 2466 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Hic2-202ENSMUST00000115698 2765 ntTSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Ptger1-201ENSMUST00000019608 4694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Sybu-202ENSMUST00000110267 3127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Phf12-201ENSMUST00000049167 4410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Tcea1-202ENSMUST00000165720 2854 ntTSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Mdm1-202ENSMUST00000163238 2461 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.92□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 4930438A08Rik-201ENSMUST00000108834 2093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Csnk1g1-212ENSMUST00000206048 2073 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Fgf13-203ENSMUST00000119833 2237 ntTSL 5 BASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
Rnf5O35445 Mrap2-203ENSMUST00000179313 2039 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.91□□□□□ -0.5
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Rnf5O35445 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC11.91□□□□□ -0.5
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