Protein–RNA interactions for Protein: O35426

Xbp1, X-box-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xbp1O35426 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Tmem9b-202ENSMUST00000118571 1771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 4933415F23Rik-201ENSMUST00000073179 1781 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Atf7-202ENSMUST00000108828 2887 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Vopp1-204ENSMUST00000145608 4590 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ppp1r2-202ENSMUST00000115233 958 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Tm4sf5-201ENSMUST00000019063 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Ucn-202ENSMUST00000201184 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Wfdc6b-201ENSMUST00000094346 984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Xbp1O35426 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Arhgap44-203ENSMUST00000093002 3982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ubn2-201ENSMUST00000039127 4243 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ttc3-201ENSMUST00000117648 7417 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Grik4-202ENSMUST00000114865 5887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Pnma1-201ENSMUST00000061425 2359 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Hyou1-204ENSMUST00000160902 3374 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Tpt1-ps6-201ENSMUST00000121768 523 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Rbm22-201ENSMUST00000025506 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 4933426K07Rik-201ENSMUST00000143009 1548 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Fzd6-202ENSMUST00000179165 4325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Aicda-202ENSMUST00000160685 1292 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Cabp2-205ENSMUST00000162908 911 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 1700028B04Rik-202ENSMUST00000190841 971 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Fam131a-201ENSMUST00000056518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm43509-201ENSMUST00000196551 2594 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Orai3-203ENSMUST00000121504 2141 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Kcna1-202ENSMUST00000203094 3150 ntAPPRIS P1 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Pdlim5-212ENSMUST00000200043 1581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Dcaf13-201ENSMUST00000022909 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Olfr718-ps1-203ENSMUST00000215102 4913 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm11453-201ENSMUST00000117318 1007 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm13054-201ENSMUST00000154192 820 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ifi27l2b-201ENSMUST00000044687 1093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Fbxw7-204ENSMUST00000107679 4473 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Glb1-201ENSMUST00000063042 2396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Xbp1O35426 Syn2-201ENSMUST00000009538 2708 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.1 ms