Protein–RNA interactions for Protein: O35305

Tnfrsf11a, Tumor necrosis factor receptor superfamily member 11A, mousemouse

Predictions only

Length 625 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tnfrsf11aO35305 Stox2-208ENSMUST00000211737 4573 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Lap3-201ENSMUST00000046122 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Dlk1-203ENSMUST00000109842 1129 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Banf1-202ENSMUST00000170010 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm5264-201ENSMUST00000190584 848 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 AC174742.1-201ENSMUST00000218272 304 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm10175-201ENSMUST00000086013 645 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Eif5-201ENSMUST00000050993 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 AI849053-201ENSMUST00000181021 2658 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Stx6-201ENSMUST00000027743 4589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Krt14-201ENSMUST00000007272 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Abat-202ENSMUST00000115838 1348 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Pdzd4-201ENSMUST00000002080 3970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Fam102a-201ENSMUST00000048375 4223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Cyp4f18-201ENSMUST00000003574 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Mrs2-201ENSMUST00000021772 7035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 4930481A15Rik-201ENSMUST00000128542 2106 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Ankle2-206ENSMUST00000197188 4077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 CN725425-202ENSMUST00000190436 2041 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Slc39a4-201ENSMUST00000073428 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Dhdds-203ENSMUST00000105886 1015 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm21586-201ENSMUST00000107988 264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm21953-201ENSMUST00000108002 264 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Grip1os3-202ENSMUST00000146294 957 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 1600014C10Rik-207ENSMUST00000179503 784 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm20878-208ENSMUST00000181518 264 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Bloc1s5-203ENSMUST00000224902 612 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Tspan18-201ENSMUST00000028646 1203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 A830031A19Rik-201ENSMUST00000068360 757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Mrps36-202ENSMUST00000078573 571 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Hist1h2bg-201ENSMUST00000079251 618 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Hist1h2bn-201ENSMUST00000091709 381 ntAPPRIS P1 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm5105-201ENSMUST00000053318 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Nabp1-205ENSMUST00000186684 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Disp2-204ENSMUST00000110846 1732 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gmppa-201ENSMUST00000037796 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Ace-201ENSMUST00000001963 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gstm7-201ENSMUST00000004137 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Rad18-202ENSMUST00000077088 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Mfsd2a-201ENSMUST00000030408 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Olfr1344-201ENSMUST00000168341 1061 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Ogfod2-207ENSMUST00000196627 532 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 AC154572.2-201ENSMUST00000225105 997 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Eif2d-202ENSMUST00000068805 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Acsl3-201ENSMUST00000035779 3950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Csgalnact2-201ENSMUST00000049344 3661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Syvn1-203ENSMUST00000134667 3159 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm11738-201ENSMUST00000134069 2158 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Rnps1-203ENSMUST00000163717 1920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Atp2c2-201ENSMUST00000095171 3222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Rxrb-202ENSMUST00000116612 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Rcn3-201ENSMUST00000019683 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Rcn3-208ENSMUST00000211352 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Lhx5-201ENSMUST00000031591 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Nudt1-204ENSMUST00000110826 606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 Gm14321-202ENSMUST00000139927 351 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Tnfrsf11aO35305 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 41.8 ms