Protein–RNA interactions for Protein: O35304

Slc18a3, Vesicular acetylcholine transporter, mousemouse

Predictions only

Length 530 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc18a3O35304 Ccdc68-201ENSMUST00000043929 1618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Srpx-201ENSMUST00000044789 2477 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Glyr1-202ENSMUST00000115844 3348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Glyr1-201ENSMUST00000023189 3330 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Prr15-201ENSMUST00000059138 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Sf3b4-201ENSMUST00000076372 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Mfrp-205ENSMUST00000206308 4037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Fbxl19-201ENSMUST00000033081 3410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ch25h-201ENSMUST00000050562 1350 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Zfp839-201ENSMUST00000170060 3723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Dennd4c-201ENSMUST00000045512 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Acbd5-206ENSMUST00000155602 1714 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Wbscr25-202ENSMUST00000148729 2075 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Arl11-202ENSMUST00000224727 2095 ntAPPRIS P1 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Robo4-205ENSMUST00000214185 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm18622-201ENSMUST00000219361 595 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gpank1-201ENSMUST00000052167 1295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ankrd16-201ENSMUST00000056108 1618 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm12620-201ENSMUST00000119791 1986 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm12612-201ENSMUST00000140182 1986 ntBASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Efnb1-201ENSMUST00000052839 3258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Nck1-202ENSMUST00000116522 4476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ints3-202ENSMUST00000071488 4038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Zfr2-201ENSMUST00000117798 3349 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 4933428G20Rik-201ENSMUST00000056955 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Scap-201ENSMUST00000098350 4227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Otop2-201ENSMUST00000055490 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ntng2-210ENSMUST00000177689 1679 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Zbtb20-203ENSMUST00000114691 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Pam-201ENSMUST00000058762 4095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Rnf152-201ENSMUST00000058688 8492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Cyp2d10-201ENSMUST00000072776 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Wbp2-202ENSMUST00000106444 1012 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Oaz2-204ENSMUST00000136166 700 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 AC171004.1-201ENSMUST00000221723 664 ntTSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Psmg3-201ENSMUST00000031531 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Tgfbr3-201ENSMUST00000031224 6087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gm37297-201ENSMUST00000192974 2384 ntBASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Sesn1-201ENSMUST00000041438 2600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Slc18a3O35304 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Pid1-207ENSMUST00000177458 2521 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Wwp2-205ENSMUST00000212543 1996 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Slc44a5-201ENSMUST00000089948 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Hps1-204ENSMUST00000160455 2952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Sipa1-203ENSMUST00000164304 3614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm5837-201ENSMUST00000191844 1369 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Lifr-201ENSMUST00000067190 4143 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Syp-201ENSMUST00000069520 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm15512-201ENSMUST00000137359 2257 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rsbn1l-201ENSMUST00000036489 5550 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Il1rn-204ENSMUST00000114487 2474 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 D530033B14Rik-201ENSMUST00000205412 546 ntTSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gm8655-201ENSMUST00000221159 852 ntBASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Tgfb1i1-207ENSMUST00000167965 1746 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Rbm33-202ENSMUST00000059644 9510 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Riox2-201ENSMUST00000023407 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Mbp-202ENSMUST00000062446 2186 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Kcnq2-220ENSMUST00000197015 8031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Chst3-203ENSMUST00000167915 1672 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Chtf18-201ENSMUST00000048054 3214 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dym-201ENSMUST00000039608 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Mxra8-201ENSMUST00000030947 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 1600014C10Rik-205ENSMUST00000178876 3283 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Slc18a3O35304 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.9 ms