Protein–RNA interactions for Protein: O35214

Rrh, Visual pigment-like receptor peropsin, mousemouse

Predictions only

Length 337 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RrhO35214 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Zfp524-202ENSMUST00000207901 1263 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 AC110091.2-202ENSMUST00000216718 1148 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 4931406C07Rik-209ENSMUST00000217042 691 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Tmem30b-201ENSMUST00000042975 2991 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Sf3b6-201ENSMUST00000046207 1180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Bhlha9-201ENSMUST00000056184 1207 ntAPPRIS P1 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Dok7-201ENSMUST00000050709 2498 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Zfp503-201ENSMUST00000043409 4216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Mrps27-201ENSMUST00000052249 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Fen1-204ENSMUST00000156291 2373 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Kmt5b-206ENSMUST00000113973 6130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Adgrb2-201ENSMUST00000030571 4734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Alx4-201ENSMUST00000042078 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Fam189b-203ENSMUST00000119707 2415 ntTSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Cc2d1b-201ENSMUST00000030320 3303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
RrhO35214 Kcnh1-201ENSMUST00000078470 7242 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RrhO35214 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RrhO35214 Mob2-206ENSMUST00000211206 2140 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RrhO35214 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
RrhO35214 Usp31-201ENSMUST00000046929 10198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.23
RrhO35214 Gm8784-201ENSMUST00000222096 1435 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ubc-203ENSMUST00000156249 2581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Apol8-201ENSMUST00000070911 1838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mgarp-203ENSMUST00000141156 1246 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Scamp3-203ENSMUST00000120697 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Dhodh-209ENSMUST00000143900 1455 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Kdf1-203ENSMUST00000121797 2256 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm38392-202ENSMUST00000165196 1303 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 2410018L13Rik-205ENSMUST00000149246 3370 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm45760-201ENSMUST00000212190 1782 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ercc6l2-202ENSMUST00000021926 1592 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
RrhO35214 1700034H15Rik-202ENSMUST00000139827 4354 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Papd7-204ENSMUST00000223344 2118 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Atat1-202ENSMUST00000061052 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gldn-201ENSMUST00000056740 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Traf2-202ENSMUST00000114234 2151 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 St6gal2-201ENSMUST00000025000 6066 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm11536-201ENSMUST00000130733 535 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Egfl8-201ENSMUST00000015611 1150 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Calcb-203ENSMUST00000182816 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 AC140264.2-201ENSMUST00000219668 289 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Cda-201ENSMUST00000030535 846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Egfl8-202ENSMUST00000097345 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Cchcr1-201ENSMUST00000045956 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Psen2-204ENSMUST00000111106 2020 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Arhgef33-202ENSMUST00000223878 3253 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Arhgef33-201ENSMUST00000068175 3260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm26669-201ENSMUST00000181323 1808 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Anp32e-201ENSMUST00000015893 1381 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Hoxb5-201ENSMUST00000049272 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gna13-201ENSMUST00000020930 6160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mdfic-201ENSMUST00000101663 3431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mdfic-206ENSMUST00000189359 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Mdfic-207ENSMUST00000190255 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
RrhO35214 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Klf15-203ENSMUST00000203039 2482 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Gimap3-201ENSMUST00000038811 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Bpifb3-202ENSMUST00000109760 1741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Pitx2-206ENSMUST00000174623 1493 ntTSL 2 BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Arl11-201ENSMUST00000055159 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
RrhO35214 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.56□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 73.7 ms