Protein–RNA interactions for Protein: O35185

Bhlhe40, Class E basic helix-loop-helix protein 40, mousemouse

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Length 411 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bhlhe40O35185 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hist1h3e-201ENSMUST00000105107 836 ntAPPRIS P1 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 AC159114.1-201ENSMUST00000220349 266 ntBASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Asb10-203ENSMUST00000119657 1536 ntTSL 5 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nf2-201ENSMUST00000053079 2470 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ovca2-201ENSMUST00000071562 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ogfrl1-201ENSMUST00000027343 4844 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Adrb3-203ENSMUST00000121838 1864 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Sdc1-205ENSMUST00000171158 2311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pcolce-201ENSMUST00000031731 1626 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.74□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Arsi-201ENSMUST00000040359 2975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Usp53-201ENSMUST00000090379 6185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pltp-201ENSMUST00000059954 1809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Fam149b-211ENSMUST00000224930 2716 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pde1c-203ENSMUST00000164037 3068 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gas2l2-201ENSMUST00000052521 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Cstf2-201ENSMUST00000033609 4502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Romo1-203ENSMUST00000109598 362 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hsf4-207ENSMUST00000174837 1251 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Smim4-202ENSMUST00000064032 791 ntTSL 3 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Rb1cc1-201ENSMUST00000027040 7607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hdhd2-203ENSMUST00000097522 2318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Trappc5-201ENSMUST00000044857 2546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Osbpl10-201ENSMUST00000046627 1872 ntTSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Rhpn2-201ENSMUST00000032705 3508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Sbk2-205ENSMUST00000208109 1422 ntTSL 5 BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mtfp1-201ENSMUST00000004868 1411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Lingo3-201ENSMUST00000053986 3439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Itga5-201ENSMUST00000023128 4382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC14.73□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Mief2-201ENSMUST00000018743 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tmtc2-201ENSMUST00000061506 5629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hdac2-202ENSMUST00000105510 3250 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Pex5l-206ENSMUST00000108226 2632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Alk-201ENSMUST00000086639 4866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Smarcc1-204ENSMUST00000197984 3538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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Bhlhe40O35185 Gm24932-201ENSMUST00000103763 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm24115-201ENSMUST00000103799 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm22190-201ENSMUST00000103827 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm22191-201ENSMUST00000103831 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm24721-201ENSMUST00000103849 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm28018-201ENSMUST00000103869 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm26399-201ENSMUST00000103937 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Platr13-201ENSMUST00000133945 375 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Zfp125-202ENSMUST00000144811 704 ntTSL 5 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Med22-201ENSMUST00000015920 973 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm25349-201ENSMUST00000177728 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm23616-201ENSMUST00000177797 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm25871-201ENSMUST00000177816 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm24752-201ENSMUST00000178240 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm24496-201ENSMUST00000178287 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm25649-201ENSMUST00000178476 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm25548-201ENSMUST00000178681 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm23147-201ENSMUST00000178841 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm26095-201ENSMUST00000179270 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm22171-201ENSMUST00000179283 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm23936-201ENSMUST00000179354 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm22619-201ENSMUST00000179516 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm25255-201ENSMUST00000179579 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm24755-201ENSMUST00000179691 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm26506-201ENSMUST00000179692 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm25086-201ENSMUST00000179931 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm23243-201ENSMUST00000180047 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm24659-201ENSMUST00000180212 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm24169-201ENSMUST00000180244 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm23689-201ENSMUST00000180354 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm27359-201ENSMUST00000184153 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm27785-201ENSMUST00000184268 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm27466-201ENSMUST00000184396 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Gm27703-201ENSMUST00000184836 110 ntBASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Ndufs6-203ENSMUST00000222930 512 ntTSL 3 BASIC14.72□□□□□ -0.05
Bhlhe40O35185 Rps10-201ENSMUST00000025052 519 ntTSL 1 (best) BASIC14.72□□□□□ -0.05
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