Protein–RNA interactions for Protein: O35177

Nedd9, Enhancer of filamentation 1, mousemouse

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Length 833 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nedd9O35177 Rmnd5b-201ENSMUST00000001081 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Garem2-201ENSMUST00000058045 3865 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Dlgap1-211ENSMUST00000148486 5276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Kctd20-202ENSMUST00000117672 2219 ntTSL 5 BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Ablim3-201ENSMUST00000049378 4532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.86■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Sema6d-208ENSMUST00000103241 6157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Eif4g1-204ENSMUST00000115460 5638 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Mtx2-201ENSMUST00000028511 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 1700051A21Rik-201ENSMUST00000147937 1516 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Islr2-203ENSMUST00000163897 4303 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Txnrd3-202ENSMUST00000101171 2494 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Ids-201ENSMUST00000101509 4972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Rabggta-203ENSMUST00000169237 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Gm29208-203ENSMUST00000213687 2219 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Gm27244-201ENSMUST00000184260 380 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Chchd1-203ENSMUST00000224633 557 ntBASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Kcnk16-201ENSMUST00000024155 916 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Mrpl54-201ENSMUST00000046114 604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Terf1-203ENSMUST00000188371 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Bpifb5-201ENSMUST00000045959 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Gm26904-201ENSMUST00000181301 1742 ntTSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Slc44a2-210ENSMUST00000217461 3478 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Elmsan1-202ENSMUST00000110294 7156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.85■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Arl5b-202ENSMUST00000069870 6981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Ccnj-202ENSMUST00000119316 3763 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Smarca5-201ENSMUST00000043359 6113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Mcmbp-201ENSMUST00000057557 4237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Wdfy3-206ENSMUST00000174698 3858 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Cnst-201ENSMUST00000040706 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Samd14-201ENSMUST00000055947 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Tmsb4x-201ENSMUST00000112172 768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Gm15920-201ENSMUST00000118998 402 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 1700066M21Rik-201ENSMUST00000042734 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 9130401M01Rik-201ENSMUST00000100655 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Trim50-201ENSMUST00000065785 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Cep170b-203ENSMUST00000179041 6565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.84■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Crem-228ENSMUST00000150235 2662 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Kcnh4-202ENSMUST00000107363 3948 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.13
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Nedd9O35177 Upf1-202ENSMUST00000215817 4518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 4930524O07Rik-203ENSMUST00000193135 2289 ntBASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.13
Nedd9O35177 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm15706-201ENSMUST00000139612 899 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Cox7a2l-201ENSMUST00000025095 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gnptg-201ENSMUST00000038973 1234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Fam159a-201ENSMUST00000053157 593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Gchfr-201ENSMUST00000057454 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Ahdc1-202ENSMUST00000105914 5898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Dhx9-201ENSMUST00000042141 4616 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Nedd9O35177 Hacd3-201ENSMUST00000036615 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
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