Protein–RNA interactions for Protein: O35160

Pitx3, Pituitary homeobox 3, mousemouse

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Length 302 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pitx3O35160 Bmper-201ENSMUST00000071982 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Smpd4-221ENSMUST00000170996 1619 ntTSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Serf1-205ENSMUST00000152286 465 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Entpd4-205ENSMUST00000184314 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 AC127349.1-201ENSMUST00000224590 266 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 AC117588.1-201ENSMUST00000228510 999 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Entpd4b-201ENSMUST00000064846 989 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Cops9-201ENSMUST00000097642 438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Myocd-202ENSMUST00000102635 4935 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tbc1d4-210ENSMUST00000162617 4762 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Pex5-201ENSMUST00000035861 3139 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Nek7-202ENSMUST00000186017 5258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm12355-201ENSMUST00000104933 1311 ntAPPRIS P1 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Slc17a9-201ENSMUST00000094218 2275 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Rnf103-203ENSMUST00000114179 2671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm5922-201ENSMUST00000214963 1723 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Slc8b1-201ENSMUST00000068326 2898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ffar2-202ENSMUST00000163504 1913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Synm-201ENSMUST00000051389 6953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Kdm2b-201ENSMUST00000031435 3532 ntTSL 1 (best) BASIC12.31□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Mctp1-204ENSMUST00000125209 4715 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ccdc85a-201ENSMUST00000042534 5332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Rxra-202ENSMUST00000100251 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Hlcs-205ENSMUST00000227141 4021 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Capn7-201ENSMUST00000022451 3648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ptdss1-201ENSMUST00000021990 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Bnipl-201ENSMUST00000098871 1414 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Loxl1-201ENSMUST00000061799 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm11946-201ENSMUST00000123459 3941 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 A230060F14Rik-202ENSMUST00000190739 1889 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Wdr31-203ENSMUST00000120095 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tm4sf4-201ENSMUST00000029377 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Map3k12-207ENSMUST00000169377 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Hist1h2bf-201ENSMUST00000105106 461 ntAPPRIS P1 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm9932-201ENSMUST00000194154 2116 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 AC158538.2-201ENSMUST00000225455 906 ntBASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Rhebl1-201ENSMUST00000024518 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Chmp1a-201ENSMUST00000000759 2140 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tbpl1-201ENSMUST00000095794 1195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Anks1b-231ENSMUST00000183136 2786 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Rtfdc1-201ENSMUST00000029005 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ftsj1-202ENSMUST00000115594 1529 ntTSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ss18-201ENSMUST00000040924 3090 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Zfp553-202ENSMUST00000106312 3342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Capn1-201ENSMUST00000025891 3100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Neurod2-201ENSMUST00000041685 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Cpne1-202ENSMUST00000109607 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gnpat-201ENSMUST00000034466 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.3□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Hnrnpa2b1-204ENSMUST00000203220 1638 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Scube1-205ENSMUST00000171496 7824 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Pde7b-205ENSMUST00000169404 1697 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Cuedc2-202ENSMUST00000167861 1941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Dstyk-204ENSMUST00000188389 3232 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Acin1-201ENSMUST00000022793 4735 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Trmu-201ENSMUST00000023019 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Tcp1-207ENSMUST00000143961 614 ntTSL 2 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Ffar2-203ENSMUST00000168528 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm20478-201ENSMUST00000173648 1031 ntTSL 3 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm27177-205ENSMUST00000184792 706 ntTSL 5 BASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Pitx3O35160 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC12.29□□□□□ -0.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms