Protein–RNA interactions for Protein: O35134

Polr1a, DNA-directed RNA polymerase I subunit RPA1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,717 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Polr1aO35134 Gm5354-201ENSMUST00000182417 973 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Aurka-202ENSMUST00000109139 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Aurka-201ENSMUST00000028997 1905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ptpn5-201ENSMUST00000033142 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ube2d-ps-205ENSMUST00000142942 1840 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Mvk-203ENSMUST00000124260 1051 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Spag7-201ENSMUST00000018431 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm27701-201ENSMUST00000184498 110 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 CT030657.3-201ENSMUST00000222707 1200 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Yipf5-201ENSMUST00000025364 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Zcchc17-202ENSMUST00000134159 2113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Slc22a18-201ENSMUST00000052348 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Atf6b-202ENSMUST00000173984 2315 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Zfp277-201ENSMUST00000069637 2188 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Dtx2-203ENSMUST00000111144 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Col13a1-203ENSMUST00000105452 3037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pla2g2e-203ENSMUST00000105804 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ccdc169-203ENSMUST00000118963 740 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 9230110C19Rik-202ENSMUST00000215478 533 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pla2g2e-201ENSMUST00000030531 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ccdc169-202ENSMUST00000061099 887 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Arrdc5-201ENSMUST00000097303 1054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Pde8b-202ENSMUST00000067082 2598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Hadh-201ENSMUST00000029610 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Rft1-201ENSMUST00000064230 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ascc1-201ENSMUST00000050516 1450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Sesn3-207ENSMUST00000209187 1700 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Cdk17-201ENSMUST00000069965 3615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm17619-201ENSMUST00000180625 1449 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Defb30-203ENSMUST00000111208 503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Defb30-204ENSMUST00000111209 721 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Chchd7-207ENSMUST00000121210 548 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm11574-201ENSMUST00000139752 946 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm7558-201ENSMUST00000193221 1165 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 AC153872.1-201ENSMUST00000199539 128 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Batf3-201ENSMUST00000027943 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Sh3bgrl3-201ENSMUST00000030651 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Tpd52-201ENSMUST00000063496 697 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Fa2h-201ENSMUST00000038475 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Fggy-203ENSMUST00000107091 1395 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Acp6-201ENSMUST00000090759 1754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Slc25a34-201ENSMUST00000038661 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Uqcrq-203ENSMUST00000109021 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Boll-202ENSMUST00000114423 1106 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm15945-201ENSMUST00000146755 810 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Hddc3-208ENSMUST00000206122 696 ntTSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 AC124510.1-201ENSMUST00000222659 583 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Wdr74-201ENSMUST00000049424 1204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ube2i-201ENSMUST00000049911 1138 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Olfr373-201ENSMUST00000074540 945 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Zufsp-205ENSMUST00000218880 2005 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ephb1-203ENSMUST00000149800 3471 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Fbxo44-205ENSMUST00000151127 1403 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Apmap-201ENSMUST00000046399 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Atcayos-202ENSMUST00000129950 1117 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm4756-204ENSMUST00000209038 990 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Anapc5-201ENSMUST00000086216 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Tcf3-207ENSMUST00000105343 2920 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Usp51-201ENSMUST00000095755 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm44616-201ENSMUST00000206417 1732 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm13883-201ENSMUST00000150450 1404 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm36839-201ENSMUST00000222088 2093 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ppp1r13b-201ENSMUST00000054815 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Klk12-201ENSMUST00000014063 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Ffar3-202ENSMUST00000185748 1234 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm18062-201ENSMUST00000208020 547 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Gm18055-201ENSMUST00000208254 547 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Tada3-203ENSMUST00000099118 1282 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Otp-201ENSMUST00000022195 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Polr1aO35134 Zscan22-204ENSMUST00000120809 1826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.9 ms