Protein–RNA interactions for Protein: O35071

Kif1c, Kinesin-like protein KIF1C, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,100 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kif1cO35071 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Ghr-201ENSMUST00000069451 4175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Neto1-201ENSMUST00000058829 3531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Axdnd1-204ENSMUST00000178036 3586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm7230-201ENSMUST00000173026 815 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Il3ra-205ENSMUST00000224877 1128 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Hacd1-201ENSMUST00000074854 926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Tmem266-201ENSMUST00000034862 2408 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Col2a1-202ENSMUST00000088355 4862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Cplx2-201ENSMUST00000026985 4928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Cacna2d1-205ENSMUST00000167946 7436 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Apaf1-201ENSMUST00000020157 6577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Galnt17-201ENSMUST00000086023 8040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Khdc1c-201ENSMUST00000070223 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Traf3ip1-201ENSMUST00000047242 3474 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Camsap2-202ENSMUST00000192001 6329 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm11780-201ENSMUST00000136880 516 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm42802-201ENSMUST00000202475 456 ntTSL 2 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 D530014G21Rik-201ENSMUST00000208416 587 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm5364-201ENSMUST00000216789 889 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Ppt1-202ENSMUST00000097902 1191 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Dzip1-201ENSMUST00000004055 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Rapsn-201ENSMUST00000050323 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Neu4-202ENSMUST00000190212 1719 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Spdya-201ENSMUST00000064420 1877 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Dmrtb1-201ENSMUST00000069271 1861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm36447-201ENSMUST00000201101 1978 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Sntb2-203ENSMUST00000212524 9945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Klf15-204ENSMUST00000203607 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm43321-201ENSMUST00000198897 2409 ntBASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Fgfr3-201ENSMUST00000067150 4218 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Epb41l1-205ENSMUST00000109574 5904 ntTSL 1 (best) BASIC14.54□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Agap1-201ENSMUST00000027521 11921 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Rnf44-211ENSMUST00000134862 3797 ntTSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Fam76b-201ENSMUST00000059579 3702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Tm9sf1-203ENSMUST00000121791 2148 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Med20-201ENSMUST00000024778 2054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 AC154527.4-201ENSMUST00000224364 1667 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Rab9-202ENSMUST00000112091 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Pqlc2-205ENSMUST00000172747 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Atat1-214ENSMUST00000149277 1388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Epha2-201ENSMUST00000006614 3913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Ftl2-ps-201ENSMUST00000118517 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm12999-201ENSMUST00000124471 485 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm21887-203ENSMUST00000180251 531 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 AL669916.2-201ENSMUST00000213219 358 ntTSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Ndufb7-201ENSMUST00000036996 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Aqp12-201ENSMUST00000059676 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm15590-201ENSMUST00000078419 552 ntBASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Ptprk-201ENSMUST00000166468 6177 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Snn-201ENSMUST00000089011 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Zkscan3-201ENSMUST00000070785 2561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Ptk7-201ENSMUST00000044442 4255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Hnrnpr-204ENSMUST00000131671 2543 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Zgpat-201ENSMUST00000029105 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Osr1-201ENSMUST00000057021 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 9130017K11Rik-202ENSMUST00000135670 3338 ntTSL 1 (best) BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Ylpm1-201ENSMUST00000021670 7003 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.53□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Prpf38b-201ENSMUST00000029480 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Camta1-211ENSMUST00000169423 5208 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Arhgef40-204ENSMUST00000182061 4756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Gm17315-201ENSMUST00000181408 2504 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Adam23-205ENSMUST00000114107 6110 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Rab3a-201ENSMUST00000034301 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Tmem116-203ENSMUST00000094357 1366 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC14.52□□□□□ -0.08
Kif1cO35071 Pcgf5-211ENSMUST00000225920 6443 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Pgam1-ps1-201ENSMUST00000119107 749 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm15492-201ENSMUST00000156734 606 ntTSL 1 (best) BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC14.52□□□□□ -0.09
Kif1cO35071 4930442P19Rik-201ENSMUST00000193163 1240 ntBASIC14.52□□□□□ -0.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.5 ms