Protein–RNA interactions for Protein: O08983

Hps1, Hermansky-Pudlak syndrome 1 protein homolog, mousemouse

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Length 704 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Hps1O08983 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Npw-202ENSMUST00000213213 531 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Hist1h2ab-201ENSMUST00000078369 473 ntAPPRIS P1 BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 P3h1-204ENSMUST00000121111 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Evc-201ENSMUST00000031005 4325 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
Hps1O08983 Pla2g10-201ENSMUST00000023364 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Fgd1-201ENSMUST00000026296 4001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cdkn1b-203ENSMUST00000204807 1757 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tap1-206ENSMUST00000170086 2953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Celf3-204ENSMUST00000197558 2414 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Naa15-205ENSMUST00000193266 7480 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 AC159649.2-201ENSMUST00000222984 3223 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Spire2-202ENSMUST00000212404 2158 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Lmx1b-201ENSMUST00000041730 4790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Plch2-201ENSMUST00000105631 5053 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gnas-211ENSMUST00000109096 2465 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rplp2-203ENSMUST00000106004 421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Zfp13-202ENSMUST00000115516 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Chchd7-205ENSMUST00000120732 711 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm1401-201ENSMUST00000122048 772 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm11594-201ENSMUST00000122313 162 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dusp15-203ENSMUST00000123121 2993 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tsen15-201ENSMUST00000015124 1133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tex30-213ENSMUST00000156392 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rnf13-209ENSMUST00000199041 1062 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Impdh1-207ENSMUST00000162099 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tmem30a-202ENSMUST00000120690 3627 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pisd-201ENSMUST00000061895 2183 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rnf138-201ENSMUST00000052396 3110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Cage1-202ENSMUST00000089840 3449 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
Hps1O08983 6430573F11Rik-205ENSMUST00000171777 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Siglece-201ENSMUST00000032667 1849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Zbtb20-202ENSMUST00000114690 2759 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Zyx-205ENSMUST00000203401 1954 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tor1aip1-201ENSMUST00000027738 1952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 F2-201ENSMUST00000028681 1988 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 A330035P11Rik-202ENSMUST00000144926 3074 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Srsf10-202ENSMUST00000097844 3055 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Ncor2-203ENSMUST00000111393 8661 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Vill-207ENSMUST00000141185 1645 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Ubp1-206ENSMUST00000216558 1623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Borcs5-201ENSMUST00000062755 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 G630022F23Rik-201ENSMUST00000202923 3627 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Acot3-201ENSMUST00000021653 3431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tpgs2-201ENSMUST00000115817 4159 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dnajc24-201ENSMUST00000102555 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Lsm12-202ENSMUST00000107156 2015 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Aldh3a1-201ENSMUST00000019246 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Adam22-203ENSMUST00000088744 9245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pofut2-201ENSMUST00000020493 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Olfr718-ps1-202ENSMUST00000213631 4737 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Tet3-203ENSMUST00000186548 5944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Nupl2-201ENSMUST00000049887 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Sox11-201ENSMUST00000079063 8311 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gss-203ENSMUST00000130881 1724 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Pcbp3-206ENSMUST00000168465 1748 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 4930431F12Rik-202ENSMUST00000199309 2263 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Zfp90-203ENSMUST00000212606 2685 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Nagk-201ENSMUST00000037376 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Rbm11-201ENSMUST00000046378 1400 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Esyt1-201ENSMUST00000026427 3981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Gm128-202ENSMUST00000107197 1289 ntTSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Timm23-206ENSMUST00000170331 777 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 Syngr2-206ENSMUST00000177131 935 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
Hps1O08983 9530052E02Rik-201ENSMUST00000180750 949 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
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