Protein–RNA interactions for Protein: O08547

Sec22b, Vesicle-trafficking protein SEC22b, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 215 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sec22bO08547 Pcdha8-201ENSMUST00000194038 5338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ccnt2-202ENSMUST00000112570 4511 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Chd1-205ENSMUST00000173311 4211 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Nr3c2-204ENSMUST00000109913 5916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC14.87□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Nyap1-201ENSMUST00000061789 3912 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Amn1-201ENSMUST00000095319 1369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Tmem81-202ENSMUST00000188789 1751 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ralgapb-201ENSMUST00000046274 8366 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Emp3-202ENSMUST00000164119 784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm2308-201ENSMUST00000166539 1004 ntBASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Prdx6-201ENSMUST00000051925 959 ntTSL 2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Rbsn-201ENSMUST00000014694 5334 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Sox21-201ENSMUST00000170662 3799 ntAPPRIS P1 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Zswim8-204ENSMUST00000223840 5674 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Tns1-222ENSMUST00000212888 5643 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.86□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ube2j2-203ENSMUST00000105581 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ccdc24-201ENSMUST00000106422 1365 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gjb1-201ENSMUST00000052130 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Lrwd1-201ENSMUST00000006301 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm37728-201ENSMUST00000195025 2292 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Dnajc6-205ENSMUST00000106933 5191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Zfp184-202ENSMUST00000102978 3198 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 4933434E20Rik-203ENSMUST00000068798 1500 ntTSL 5 BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Aarsd1-201ENSMUST00000070395 1516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Slc30a2-201ENSMUST00000081094 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.85□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Olfr1372-ps1-202ENSMUST00000203403 9812 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Nop56-202ENSMUST00000103198 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 4930513N10Rik-203ENSMUST00000145562 2803 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Synj1-203ENSMUST00000121759 7090 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Large2-214ENSMUST00000176774 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Nup54-201ENSMUST00000038514 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Micall2-201ENSMUST00000044642 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ptp4a3-201ENSMUST00000053232 3608 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Celf4-206ENSMUST00000224553 1729 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm14780-201ENSMUST00000118387 2737 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Bbx-204ENSMUST00000114477 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Miga1-204ENSMUST00000199334 4024 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Mtus2-204ENSMUST00000110514 1532 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Dlk2-203ENSMUST00000166617 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm21887-202ENSMUST00000179760 483 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gtf3c2-202ENSMUST00000200871 318 ntTSL 3 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Timm10b-211ENSMUST00000210350 529 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Atp5o-201ENSMUST00000023677 838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Rhox6-201ENSMUST00000006362 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gtpbp3-201ENSMUST00000007754 2800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Marveld3-201ENSMUST00000001722 1330 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gins4-201ENSMUST00000033950 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Sowaha-201ENSMUST00000104955 3702 ntAPPRIS P1 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Chd4-203ENSMUST00000112392 6652 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Miip-202ENSMUST00000119975 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Cdkl3-201ENSMUST00000063303 2765 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Gm26608-201ENSMUST00000180740 1954 ntTSL 1 (best) BASIC14.84□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Eif5a-207ENSMUST00000108610 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Pias2-201ENSMUST00000114776 2089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.03
Sec22bO08547 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Elac1-201ENSMUST00000041138 4971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Slc4a4-207ENSMUST00000148750 7931 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Ilvbl-209ENSMUST00000218885 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
Sec22bO08547 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.83□□□□□ -0.04
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