Protein–RNA interactions for Protein: M0QWN7

Usp35, Ubiquitin-specific peptidase 35, mousemouse

Predictions only

Length 1,009 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp35M0QWN7 G2e3-202ENSMUST00000119211 2926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Max-202ENSMUST00000110395 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Mdp1-201ENSMUST00000002400 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Plcxd1-201ENSMUST00000086687 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm38042-201ENSMUST00000191614 5208 ntBASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rnf111-201ENSMUST00000034739 4880 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Tmco1-204ENSMUST00000195015 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Htr7-202ENSMUST00000164639 3057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Repin1-202ENSMUST00000118229 3138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rabl2-201ENSMUST00000023294 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Lypd1-201ENSMUST00000027582 1447 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Lmcd1-201ENSMUST00000032376 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Hist1h4k-201ENSMUST00000102983 312 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Tspo-201ENSMUST00000047419 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Olfr615-201ENSMUST00000098198 942 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Tnfrsf13c-202ENSMUST00000109535 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Dph5-204ENSMUST00000189799 1558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Plxnb1-201ENSMUST00000072093 8649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Denr-201ENSMUST00000023869 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Megf9-202ENSMUST00000107359 7924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Chst11-201ENSMUST00000040110 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 9230020A06Rik-203ENSMUST00000214621 1682 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Col7a1-201ENSMUST00000026740 9198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Hnrnpul1-205ENSMUST00000206832 3784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rad23b-201ENSMUST00000030134 3810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Klc1-203ENSMUST00000120544 2261 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gjb1-202ENSMUST00000119080 1513 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Acaa2-201ENSMUST00000041053 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Dpm3-202ENSMUST00000107462 827 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ndufa1-201ENSMUST00000016571 419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 A230087F16Rik-202ENSMUST00000181561 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Pitpnm2-209ENSMUST00000161938 5866 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Cryzl1-201ENSMUST00000073466 1965 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm38318-201ENSMUST00000195769 1706 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Iqsec3-201ENSMUST00000046373 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Zfp451-201ENSMUST00000019861 3958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 CT025610.1-201ENSMUST00000224552 1786 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rmi2-201ENSMUST00000037913 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Arhgef40-216ENSMUST00000182760 5130 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Nap1l5-201ENSMUST00000059539 1844 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm45351-201ENSMUST00000210683 2545 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 March4-201ENSMUST00000047786 4553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Pqlc2-201ENSMUST00000053862 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Sigirr-206ENSMUST00000210167 1897 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ggn-204ENSMUST00000208330 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rasgrp2-208ENSMUST00000113476 2296 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Arl5c-201ENSMUST00000042971 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 AL691505.1-201ENSMUST00000219965 1618 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Rubcn-201ENSMUST00000040986 5257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Acyp1-203ENSMUST00000117138 735 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ndufa5-202ENSMUST00000118558 315 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ms4a6d-202ENSMUST00000125291 679 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Slc7a10-203ENSMUST00000135452 629 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Mir7036b-201ENSMUST00000184791 63 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Prdx4-201ENSMUST00000026328 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 1600017P15Rik-201ENSMUST00000083427 412 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ssfa2-202ENSMUST00000111785 5168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Islr2-205ENSMUST00000170421 4071 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Synm-204ENSMUST00000208231 4457 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Fam103a1-202ENSMUST00000118190 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Lrrc56-201ENSMUST00000047093 2197 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 2010007H06Rik-202ENSMUST00000186025 4934 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
Usp35M0QWN7 Ntng2-203ENSMUST00000091153 1695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.8 ms