Protein–RNA interactions for Protein: L7N291

Gm8857, Predicted gene 8857 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm8857L7N291 Htr7-205ENSMUST00000166074 3079 ntTSL 5 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Slc41a1-201ENSMUST00000086559 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Cers5-202ENSMUST00000109035 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Tmem39a-214ENSMUST00000171687 2667 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Sorbs1-225ENSMUST00000226047 2582 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Myc-202ENSMUST00000159327 2186 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rab32-201ENSMUST00000019974 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Cflar-204ENSMUST00000114309 2010 ntTSL 1 (best) BASIC13.51□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rab34-203ENSMUST00000108322 1685 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Arrdc1-201ENSMUST00000028349 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Cobll1-201ENSMUST00000090896 4867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Cdk2-202ENSMUST00000026416 2406 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Slc38a1-201ENSMUST00000088452 7266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Cul5-209ENSMUST00000166367 5942 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Hcn3-201ENSMUST00000029686 4002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rbm3-206ENSMUST00000115621 1338 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Sall2-202ENSMUST00000135523 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Tbc1d1-201ENSMUST00000043893 6471 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Syt1-201ENSMUST00000064054 4745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 1700020A23Rik-202ENSMUST00000110281 521 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gm25745-201ENSMUST00000174945 133 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Smim22-208ENSMUST00000185147 399 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Dcdc2c-201ENSMUST00000020963 1041 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rbfox2-207ENSMUST00000227533 1041 ntBASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Olfr1272-201ENSMUST00000099750 927 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Xpot-201ENSMUST00000039810 5992 ntTSL 5 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Otud4-203ENSMUST00000173286 7213 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Il10rb-201ENSMUST00000023691 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Hmga1b-201ENSMUST00000105046 1626 ntAPPRIS P1 BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Cmtm3-201ENSMUST00000034343 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Usp19-201ENSMUST00000006854 4791 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.5□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Zkscan3-202ENSMUST00000116433 1421 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Pomgnt2-206ENSMUST00000216669 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rnf11-201ENSMUST00000030284 4061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 4933405L10Rik-201ENSMUST00000013302 1214 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Mir6404-201ENSMUST00000183699 94 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 AC160338.1-201ENSMUST00000214232 705 ntBASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Ptprcap-201ENSMUST00000061086 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Pcdhgc4-203ENSMUST00000195239 2272 ntTSL 3 BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Zfp362-201ENSMUST00000071108 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Sec24a-203ENSMUST00000109092 2094 ntTSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Mbp-203ENSMUST00000075372 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rad51-201ENSMUST00000028795 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Phka1-201ENSMUST00000043596 5938 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.49□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Srrm1-208ENSMUST00000136342 3152 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rps6ka5-209ENSMUST00000222731 5642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Zfp628-201ENSMUST00000116354 3523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Unc93b1-203ENSMUST00000162708 2266 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 AC148324.1-201ENSMUST00000219034 4240 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Josd1-201ENSMUST00000023061 3394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Ski-202ENSMUST00000084103 5309 ntTSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Ahsa1-201ENSMUST00000021425 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Klhl33-204ENSMUST00000227271 5513 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Macrod2-204ENSMUST00000110062 3554 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gm29676-201ENSMUST00000222396 1689 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Map2k7-202ENSMUST00000062686 3525 ntTSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Nsun7-203ENSMUST00000201100 2775 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Fbxo34-203ENSMUST00000163324 3132 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Dnmt3a-ps1-201ENSMUST00000192011 1271 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Loxl2-202ENSMUST00000100420 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 D1Pas1-201ENSMUST00000045108 3212 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Iqck-201ENSMUST00000098087 1503 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gm43951-201ENSMUST00000204457 2889 ntAPPRIS P1 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Apoa4-201ENSMUST00000034585 1815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Nap1l1-201ENSMUST00000065917 1486 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.48□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Grb2-203ENSMUST00000106497 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Ttc14-202ENSMUST00000108210 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Tatdn2-205ENSMUST00000204753 2645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Cxcr5-201ENSMUST00000062215 2614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Gm8857L7N291 Pcdha6-202ENSMUST00000193777 5367 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.47□□□□□ -0.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms