Protein–RNA interactions for Protein: L7N243

Gm20939, Predicted gene, 20939, mousemouse

Predictions only

Length 523 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20939L7N243 Myh14-204ENSMUST00000207775 6499 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Agap1-202ENSMUST00000074945 10069 ntTSL 5 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Ccdc50-203ENSMUST00000100026 7089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Atxn7-202ENSMUST00000223714 2954 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Cct6b-202ENSMUST00000100722 1871 ntTSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Arf3-201ENSMUST00000053183 3579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.18□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Sorbs1-208ENSMUST00000224247 2688 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Tsacc-202ENSMUST00000107556 584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 0610025J13Rik-201ENSMUST00000131324 652 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm15635-203ENSMUST00000148972 554 ntTSL 2 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Tmem255b-201ENSMUST00000167071 1138 ntTSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Smarca5-ps-202ENSMUST00000171805 1284 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm5864-201ENSMUST00000202263 970 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Lce1l-201ENSMUST00000054426 670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 4930402H24Rik-202ENSMUST00000110243 1984 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Anks1b-202ENSMUST00000099366 2549 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Mapk8ip3-207ENSMUST00000121723 5410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Cux1-212ENSMUST00000176778 5520 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.17□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Crmp1-202ENSMUST00000114158 3051 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Pitpnm1-202ENSMUST00000100022 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm45504-201ENSMUST00000211407 2107 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 St3gal3-202ENSMUST00000097912 2143 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Acly-202ENSMUST00000107385 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Pank3-201ENSMUST00000018990 7376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Slc33a1-202ENSMUST00000160883 1978 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Cpsf6-206ENSMUST00000176670 2227 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Bst1-201ENSMUST00000101237 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Syndig1-201ENSMUST00000109934 2081 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm28659-201ENSMUST00000188013 759 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm42413-201ENSMUST00000196216 338 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Ndufs8-201ENSMUST00000075092 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Grk5-201ENSMUST00000003313 3165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Ltv1-201ENSMUST00000019950 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm17108-201ENSMUST00000168625 2877 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Spcs2-210ENSMUST00000209032 1610 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Bicc1-201ENSMUST00000014473 3231 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Glis1-202ENSMUST00000106738 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Bahd1-201ENSMUST00000036578 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Zbtb33-202ENSMUST00000115142 2567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Ttc22-201ENSMUST00000047922 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Btaf1-201ENSMUST00000099494 7204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Cpeb2-205ENSMUST00000169035 7050 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Arfip1-203ENSMUST00000143514 1343 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Acss3-201ENSMUST00000044668 2494 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Rrnad1-206ENSMUST00000160074 1620 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Ctcflos-201ENSMUST00000142165 469 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Csrp3-202ENSMUST00000167786 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm26549-201ENSMUST00000181112 1209 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Map7d1-203ENSMUST00000122129 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Fuca1-201ENSMUST00000030434 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm20939L7N243 Pqbp1-202ENSMUST00000115654 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
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