Protein–RNA interactions for Protein: K7N746

Gm2888, Predicted gene 2888, mousemouse

Predictions only

Length 267 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2888K7N746 Btbd3-202ENSMUST00000091556 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Otub1-201ENSMUST00000025679 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Oas1b-201ENSMUST00000086377 1832 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Rps6kl1-201ENSMUST00000019379 2304 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Kazn-201ENSMUST00000036476 3843 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Rab3a-202ENSMUST00000110090 1375 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Ntpcr-205ENSMUST00000143504 520 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Cystm1-205ENSMUST00000152804 445 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Gm16026-204ENSMUST00000162652 683 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 1700025N23Rik-201ENSMUST00000186189 915 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 AC140397.2-201ENSMUST00000224213 834 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Wipi1-201ENSMUST00000047186 3338 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Pcdha2-201ENSMUST00000115662 5361 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Foxc2-201ENSMUST00000054691 2725 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Zfp423-202ENSMUST00000109655 4907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Npnt-206ENSMUST00000117811 4532 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Stra8-201ENSMUST00000031876 1803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Fyn-202ENSMUST00000099967 3528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Cnot11-203ENSMUST00000161515 3482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tbl1x-201ENSMUST00000088217 5234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Dpagt1-201ENSMUST00000054708 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Lurap1-201ENSMUST00000030469 5742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Rhbg-201ENSMUST00000171887 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Papd5-202ENSMUST00000118952 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Hist1h4n-201ENSMUST00000102979 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Hist1h4m-201ENSMUST00000104941 402 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Dnajc8-205ENSMUST00000105939 746 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Crybb3-202ENSMUST00000117143 749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Gm11505-201ENSMUST00000130442 737 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Crem-221ENSMUST00000142690 1256 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 9530003J23Rik-202ENSMUST00000159193 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Sema6d-201ENSMUST00000051419 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Pnpo-201ENSMUST00000018803 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Sox13-205ENSMUST00000153799 3693 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Arpp19-201ENSMUST00000007800 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Efr3b-201ENSMUST00000111178 6547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Srpx-203ENSMUST00000115544 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Ptpa-201ENSMUST00000042055 2586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Gk5-201ENSMUST00000085217 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Kpna4-201ENSMUST00000029353 8819 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Asic1-201ENSMUST00000023758 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tor1aip2-205ENSMUST00000111757 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Shroom3-203ENSMUST00000113055 6765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Fam214b-204ENSMUST00000107958 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Fzd10-201ENSMUST00000117102 3250 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tnfrsf13b-202ENSMUST00000101103 750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Mir449b-201ENSMUST00000104833 80 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Adprm-201ENSMUST00000116363 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 1810032O08Rik-206ENSMUST00000144049 966 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 AA543401-201ENSMUST00000164248 1269 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Timm13-203ENSMUST00000218481 471 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Gjb6-201ENSMUST00000039380 2105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Gm5089-201ENSMUST00000081580 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Bnc1-201ENSMUST00000026096 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Zc3h13-203ENSMUST00000227049 6144 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Sh3bgr-201ENSMUST00000048770 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Tex13a-201ENSMUST00000096314 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Rdx-201ENSMUST00000000590 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
Gm2888K7N746 Irs2-201ENSMUST00000040514 6323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Wee1-201ENSMUST00000033326 3419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Gm2888K7N746 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms