Protein–RNA interactions for Protein: J3QQ02

Gm2056, Predicted gene 2056, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm2056J3QQ02 Gm2272-201ENSMUST00000194903 582 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Krtap19-3-201ENSMUST00000075284 526 ntAPPRIS P1 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cdx2-201ENSMUST00000031650 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gbe1-203ENSMUST00000163832 2984 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mccc1-201ENSMUST00000029259 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Srgn-204ENSMUST00000160987 1727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cnot10-206ENSMUST00000216785 1723 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Pld2-202ENSMUST00000108556 3391 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm10564-201ENSMUST00000097750 3113 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rnf181-201ENSMUST00000069580 1434 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nsmaf-201ENSMUST00000029910 3507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 P4ha2-215ENSMUST00000174616 2094 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Pld5-202ENSMUST00000111166 1370 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Commd10-201ENSMUST00000049388 1561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mib1-201ENSMUST00000052838 10231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Zfp316-202ENSMUST00000161448 6891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm6018-201ENSMUST00000216090 1306 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Slc35e4-202ENSMUST00000109995 3063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Slc35e4-201ENSMUST00000051207 3059 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Irgc1-201ENSMUST00000080594 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Irf7-201ENSMUST00000026571 1916 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tnnc2-201ENSMUST00000103095 700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Trav3-1-201ENSMUST00000103569 385 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Trav3-4-201ENSMUST00000103670 458 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Hpca-207ENSMUST00000139450 812 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Arpp19-210ENSMUST00000170308 429 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Snx14-206ENSMUST00000173039 2970 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Skiv2l-ps1-201ENSMUST00000173935 658 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm25948-201ENSMUST00000175334 112 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 AC158982.1-201ENSMUST00000228377 901 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm10073-201ENSMUST00000073722 496 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Rplp1-201ENSMUST00000008036 499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cuedc1-201ENSMUST00000018522 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tomm34-201ENSMUST00000018466 2302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mageh1-201ENSMUST00000051484 1410 ntAPPRIS P1 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm45293-201ENSMUST00000209754 1812 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm44443-201ENSMUST00000204396 5633 ntBASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Epor-201ENSMUST00000006397 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Agpat1-202ENSMUST00000114140 1941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Agpat1-208ENSMUST00000174595 1911 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Phyhd1-204ENSMUST00000113645 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mef2b-205ENSMUST00000163756 1337 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Fgf17-202ENSMUST00000227123 1336 ntBASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Psen2-201ENSMUST00000010753 2004 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Pcdha7-201ENSMUST00000192631 5337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Fbxo44-202ENSMUST00000105705 1034 ntTSL 2 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tspan5-203ENSMUST00000121826 1114 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tctn3-202ENSMUST00000132452 1271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Gm11201-201ENSMUST00000143473 701 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Nespas-202ENSMUST00000150276 1262 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Tmem38a-203ENSMUST00000212763 882 ntTSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Lce3e-201ENSMUST00000098886 607 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Mis12-206ENSMUST00000164220 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Cpeb3-201ENSMUST00000079754 5899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Sema6b-201ENSMUST00000001256 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.13
Gm2056J3QQ02 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fam169b-201ENSMUST00000098378 2776 ntTSL 5 BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Nipal2-201ENSMUST00000040791 4331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Syf2-201ENSMUST00000030622 1369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tmed1-201ENSMUST00000034698 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Acp5-201ENSMUST00000069330 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gprin1-201ENSMUST00000099506 4141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tcf25-205ENSMUST00000212470 2572 ntTSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fam53b-203ENSMUST00000097999 5465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.21□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tmem65-201ENSMUST00000072113 3747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Fam160a2-203ENSMUST00000118726 2855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tead2-203ENSMUST00000107801 3396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Erlec1-201ENSMUST00000073192 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Dclk2-201ENSMUST00000029719 4012 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Npr3-201ENSMUST00000066529 6892 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Insc-201ENSMUST00000117543 2170 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Sgms1-201ENSMUST00000099514 3665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Gm13857-203ENSMUST00000150561 2337 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Zfp36l3-201ENSMUST00000071711 2347 ntAPPRIS P1 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Cgnl1-203ENSMUST00000122065 4487 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Sec11a-201ENSMUST00000026818 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Pam-210ENSMUST00000161567 3630 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 AC093043.3-201ENSMUST00000226531 2273 ntBASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Nap1l4-201ENSMUST00000072727 2285 ntTSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Gm2056J3QQ02 Sik1-201ENSMUST00000024839 4511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.2□□□□□ -0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms