Protein–RNA interactions for Protein: J3QPL3

Gm5225, Predicted gene 5225, mousemouse

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Length 108 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5225J3QPL3 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm13294-201ENSMUST00000121757 1330 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Camk2g-217ENSMUST00000226630 1937 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Appbp2-201ENSMUST00000018625 6463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Kif21a-201ENSMUST00000067205 6307 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm21981-201ENSMUST00000143789 2721 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Myo15b-202ENSMUST00000093911 9340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm43598-201ENSMUST00000202482 2479 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Arhgef1-218ENSMUST00000206508 3195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Nfatc1-204ENSMUST00000170905 4896 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 2810030D12Rik-203ENSMUST00000190461 1039 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 AC084391.1-201ENSMUST00000200651 141 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 1110035H17Rik-202ENSMUST00000205672 1231 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Mrpl46-201ENSMUST00000032841 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 9430038I01Rik-201ENSMUST00000068996 1126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Arhgef2-223ENSMUST00000176804 3086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Diras2-201ENSMUST00000057442 4786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Scamp1-201ENSMUST00000022197 4259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Cdhr5-201ENSMUST00000080654 2133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Gm5225J3QPL3 Adcy3-204ENSMUST00000127756 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Sppl2b-201ENSMUST00000035597 2869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Hspa1a-201ENSMUST00000087328 2967 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm13111-201ENSMUST00000136217 3542 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Foxo1-201ENSMUST00000053764 8665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Zfp574-201ENSMUST00000053410 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Naa15-201ENSMUST00000029303 6090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm18733-201ENSMUST00000173950 856 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm9925-201ENSMUST00000066583 483 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm10313-201ENSMUST00000095320 1002 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gnb2-212ENSMUST00000150063 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Tcf19-203ENSMUST00000161012 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 D17Wsu92e-202ENSMUST00000114859 3522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Slc32a1-201ENSMUST00000045738 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Top3b-201ENSMUST00000023465 3073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm11873-201ENSMUST00000117877 1304 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Parm1-201ENSMUST00000040576 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Syk-203ENSMUST00000120135 5363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Cab39-202ENSMUST00000113360 3805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Chd3-201ENSMUST00000092971 6066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Alas1-207ENSMUST00000141118 3399 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Snx11-201ENSMUST00000021246 2551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rad18-201ENSMUST00000068487 2577 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 AC025913.2-201ENSMUST00000220136 1766 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Ccl27a-217ENSMUST00000155240 343 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Gm16845-202ENSMUST00000216270 567 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Timm9-205ENSMUST00000221178 529 ntTSL 3 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 AC133598.3-202ENSMUST00000224219 531 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Rogdi-202ENSMUST00000090453 652 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Apol7d-201ENSMUST00000097699 826 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Cdr2l-201ENSMUST00000053288 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Zmym3-201ENSMUST00000063577 6057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Map6d1-201ENSMUST00000040880 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm5225J3QPL3 Hsph1-209ENSMUST00000202089 3054 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms