Protein–RNA interactions for Protein: J3QP53

Gm5294, Predicted gene 5294, mousemouse

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Length 216 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm5294J3QP53 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ttll3-202ENSMUST00000038889 3114 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Wtap-201ENSMUST00000007007 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Wdr61-203ENSMUST00000121204 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 C530008M17Rik-205ENSMUST00000121851 1165 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Sec22b-202ENSMUST00000122288 1177 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Psma6-204ENSMUST00000163070 787 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 4930477E14Rik-201ENSMUST00000181412 621 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm38708-201ENSMUST00000203855 677 ntTSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Zfp810-203ENSMUST00000215202 822 ntTSL 3 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 AC164629.2-201ENSMUST00000217916 270 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Wdr90-201ENSMUST00000079461 5991 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Nkx3-1-201ENSMUST00000022646 3195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 A230072C01Rik-202ENSMUST00000136447 1412 ntTSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC11.68□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tmtc4-201ENSMUST00000037726 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Arhgef10l-206ENSMUST00000105799 4508 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Slc22a18-202ENSMUST00000105917 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gatsl3-201ENSMUST00000020699 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Reps2-202ENSMUST00000112334 7675 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Mex3c-201ENSMUST00000091852 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Sgpl1-202ENSMUST00000122259 4102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Cxcr3-201ENSMUST00000056614 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm6184-201ENSMUST00000120403 1261 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Lgals3-204ENSMUST00000150290 1298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Wdyhv1-204ENSMUST00000226955 1094 ntBASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 6030498E09Rik-201ENSMUST00000050744 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ythdf2-201ENSMUST00000085181 955 ntTSL 2 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Psma5-201ENSMUST00000090569 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Spred1-201ENSMUST00000028829 6016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Kcnh1-202ENSMUST00000110844 7161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ndufab1-203ENSMUST00000123296 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 AI661453-201ENSMUST00000037701 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Loxl4-203ENSMUST00000164786 2617 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Atp13a3-201ENSMUST00000061350 7220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC11.67□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ttpa-202ENSMUST00000117632 3123 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Skor1-201ENSMUST00000055281 3657 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Rps3-201ENSMUST00000032998 1908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Magi1-208ENSMUST00000204347 7929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Card9-201ENSMUST00000028294 1880 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Med16-201ENSMUST00000105378 3197 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ppp1r12b-202ENSMUST00000086444 3137 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Dnajc2-202ENSMUST00000115192 1132 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm13036-201ENSMUST00000117799 748 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm15598-201ENSMUST00000156965 763 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Dhrs7c-205ENSMUST00000168612 1108 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm5914-202ENSMUST00000182863 375 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Tmem270-202ENSMUST00000201316 847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Gm42670-201ENSMUST00000201816 1292 ntBASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Pih1d1-206ENSMUST00000210139 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Lamtor4-201ENSMUST00000062067 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Krt25-201ENSMUST00000038004 1989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Stk40-202ENSMUST00000116286 3860 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Lsr-202ENSMUST00000098553 1930 ntTSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Unc5a-202ENSMUST00000109994 3827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Ephb1-201ENSMUST00000035129 4667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
Gm5294J3QP53 Acin1-224ENSMUST00000167015 1746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.66□□□□□ -0.54
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