Protein–RNA interactions for Protein: J3QNP2

Smim18, Small integral membrane protein 18, mousemouse

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Length 93 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Smim18J3QNP2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Foxj3-201ENSMUST00000044564 4789 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Aspg-201ENSMUST00000079400 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.97□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Six4-201ENSMUST00000043208 6402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Stau1-204ENSMUST00000109238 2976 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Phax-202ENSMUST00000130163 1386 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Rbfox2-209ENSMUST00000228087 1694 ntAPPRIS ALT2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Nphs2-201ENSMUST00000027896 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Slc10a3-202ENSMUST00000073067 1910 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ghrhr-202ENSMUST00000203241 1328 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ctdspl2-204ENSMUST00000110578 3386 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Dgcr8-202ENSMUST00000115633 4522 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Tpm2-201ENSMUST00000030184 2175 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Trim3-201ENSMUST00000057525 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Arhgef4-201ENSMUST00000047664 3287 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Paip2-205ENSMUST00000115737 713 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Ube2i-213ENSMUST00000174031 824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gm26829-201ENSMUST00000180581 934 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Gins3-202ENSMUST00000212434 654 ntTSL 2 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 CR974585.1-201ENSMUST00000221790 1263 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Mrps10-201ENSMUST00000060752 1109 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Laptm5-207ENSMUST00000151698 2600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.33
Smim18J3QNP2 Klhl8-203ENSMUST00000112815 2898 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Snph-201ENSMUST00000028951 4730 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ugt1a8-201ENSMUST00000113139 2227 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Slit1-202ENSMUST00000166496 4556 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Kbtbd6-202ENSMUST00000226192 2984 ntAPPRIS P2 BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Uimc1-202ENSMUST00000099496 1678 ntTSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Sfpq-201ENSMUST00000030623 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Adgrg3-201ENSMUST00000051259 2439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.96□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Dmxl1-202ENSMUST00000180611 11319 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ints10-203ENSMUST00000110241 2322 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Slc25a15-201ENSMUST00000033871 3430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Phactr3-202ENSMUST00000103066 2680 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Aldh16a1-201ENSMUST00000107815 2685 ntTSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Stxbp3-202ENSMUST00000106596 553 ntTSL 2 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm11627-201ENSMUST00000107080 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ypel3-210ENSMUST00000170882 1050 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 A730056A06Rik-202ENSMUST00000206959 526 ntTSL 3 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Fam167b-201ENSMUST00000052835 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Scn4b-201ENSMUST00000060125 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 R3hdm2-212ENSMUST00000166820 4281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cdh11-201ENSMUST00000075190 5647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Med14-202ENSMUST00000096495 6963 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Dnajc27-201ENSMUST00000020986 4698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Nkd2-202ENSMUST00000118096 2801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Selenok-201ENSMUST00000112268 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Fars2-205ENSMUST00000224241 1665 ntAPPRIS P1 BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Mapk8ip3-206ENSMUST00000120035 4125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Trpm4-209ENSMUST00000211743 3673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Rnf144a-201ENSMUST00000020971 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Zbtb14-201ENSMUST00000062369 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gga3-202ENSMUST00000106508 3582 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.95□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm13337-201ENSMUST00000119183 1594 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Arid3a-203ENSMUST00000105377 4952 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm34376-201ENSMUST00000218529 2107 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ccdc162-203ENSMUST00000099932 2742 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Nfxl1-202ENSMUST00000087216 3712 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ythdf2-203ENSMUST00000152796 4129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm37861-201ENSMUST00000193534 2869 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Stx6-209ENSMUST00000195302 955 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Zbtb49-202ENSMUST00000114113 2645 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ctbp1-212ENSMUST00000202962 3595 ntTSL 2 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Hps3-202ENSMUST00000108321 3385 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Luc7l3-209ENSMUST00000166312 5244 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Erbb2-201ENSMUST00000058295 5012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Popdc2-201ENSMUST00000023494 2169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Dis3-201ENSMUST00000042471 5150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Zscan29-205ENSMUST00000163766 3611 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 A430093F15Rik-204ENSMUST00000186596 2115 ntTSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cabp1-201ENSMUST00000031519 1370 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.94□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ank1-208ENSMUST00000121075 1740 ntTSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Lrp10-201ENSMUST00000022782 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Gm11992-201ENSMUST00000043285 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Cr1l-208ENSMUST00000194111 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Rasal3-201ENSMUST00000063824 3681 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Ralgds-202ENSMUST00000100241 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
Smim18J3QNP2 Tjap1-202ENSMUST00000164342 2559 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.93□□□□□ -0.34
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