Protein–RNA interactions for Protein: J3QNG1

Gm6408, Predicted gene 6408, mousemouse

Predictions only

Length 320 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm6408J3QNG1 Tcf19-202ENSMUST00000160885 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Dsn1-202ENSMUST00000103130 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Cyp4f37-201ENSMUST00000077639 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Mrpl58-203ENSMUST00000106539 2522 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Eps8l1-201ENSMUST00000086372 2522 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 B9d2-201ENSMUST00000108403 1021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Tfpt-202ENSMUST00000108641 1166 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Scpep1os-201ENSMUST00000139592 811 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 1700108N11Rik-201ENSMUST00000153051 917 ntTSL 2 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm4189-202ENSMUST00000174167 367 ntTSL 3 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Abhd18-206ENSMUST00000203650 797 ntTSL 5 BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm16976-202ENSMUST00000127408 1515 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Wdr47-201ENSMUST00000051145 4222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Iqcm-201ENSMUST00000034033 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Itgav-201ENSMUST00000028499 7054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Smtnl2-202ENSMUST00000108500 3572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Cnnm2-201ENSMUST00000077666 3492 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Ccdc181-201ENSMUST00000027867 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Cul3-201ENSMUST00000163119 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Rtf1-201ENSMUST00000028767 4664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Dnmt3b-210ENSMUST00000109774 4320 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Tomm70a-201ENSMUST00000166897 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Txnrd1-206ENSMUST00000219442 3531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm3928-201ENSMUST00000121141 1307 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Irf8-205ENSMUST00000162001 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Rtn4-201ENSMUST00000060992 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fech-201ENSMUST00000025484 2901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm25990-201ENSMUST00000102440 86 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Bpifa3-202ENSMUST00000109746 1102 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Hnrnpa1l2-ps-201ENSMUST00000129154 964 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Platr15-201ENSMUST00000147128 768 ntTSL 5 BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 AC151836.1-202ENSMUST00000226259 753 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 9130024F11Rik-202ENSMUST00000185204 2628 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Abcf2-201ENSMUST00000030795 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Ints8-203ENSMUST00000108319 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Kcnn1-208ENSMUST00000212611 2528 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Sox5-202ENSMUST00000077160 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm37500-201ENSMUST00000192059 1443 ntBASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Mapk9-201ENSMUST00000020634 4675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Nfe2l2-201ENSMUST00000102672 2475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Slc38a7-201ENSMUST00000040481 3333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Abhd15-201ENSMUST00000094004 2662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.99□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Slc6a9-201ENSMUST00000030269 3479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 9330121J05Rik-201ENSMUST00000192267 3009 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Rusc2-207ENSMUST00000131668 5093 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Dbn1-203ENSMUST00000109923 2940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Lrrc41-201ENSMUST00000030471 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Trmt112-ps2-201ENSMUST00000117987 378 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fgf20-202ENSMUST00000118639 587 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Hbb-bh0-201ENSMUST00000124800 129 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm18489-201ENSMUST00000172565 551 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Rbm14-203ENSMUST00000180008 370 ntTSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm29629-201ENSMUST00000187926 386 ntTSL 3 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fosb-206ENSMUST00000208446 1090 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Birc2-201ENSMUST00000054878 378 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Lman2l-204ENSMUST00000125304 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Stxbp1-201ENSMUST00000050000 3892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Ankrd10-202ENSMUST00000169782 5156 ntTSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Pik3c2b-201ENSMUST00000077730 7928 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm10676-201ENSMUST00000098778 3221 ntBASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Scube2-203ENSMUST00000106729 3563 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.98□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Dyrk3-201ENSMUST00000016670 3164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Nsg2-201ENSMUST00000020537 2239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Rgs14-201ENSMUST00000063771 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Fam109b-201ENSMUST00000050349 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Vrk3-201ENSMUST00000002275 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Psma3-204ENSMUST00000160864 859 ntTSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm5682-201ENSMUST00000173402 505 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Gm44202-201ENSMUST00000203549 532 ntTSL 3 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Prm1-201ENSMUST00000023144 469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.97□□□□□ -0.01
Gm6408J3QNG1 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.97□□□□□ -0.01
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.8 ms