Protein–RNA interactions for Protein: J3QNE4

Ccdc180, Coiled-coil domain-containing 180, mousemouse

Predictions only

Length 1,664 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc180J3QNE4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Tpm3-202ENSMUST00000118566 2190 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Tmem204-201ENSMUST00000024984 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Ptpa-203ENSMUST00000113603 2169 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm16194-204ENSMUST00000141797 475 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Tm2d3-207ENSMUST00000206517 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Hdhd3-201ENSMUST00000037820 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Ccdc58-201ENSMUST00000099937 747 ntTSL 3 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 0610009E02Rik-201ENSMUST00000133463 1609 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Taf1a-201ENSMUST00000097043 1472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Sectm1a-203ENSMUST00000106119 1302 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Tmprss12-201ENSMUST00000096200 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Nkpd1-202ENSMUST00000207576 2916 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm15939-201ENSMUST00000160756 2147 ntTSL 5 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Cmss1-201ENSMUST00000114371 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Tex30-211ENSMUST00000150911 960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Hnrnpa3-202ENSMUST00000111961 1734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Actg1-204ENSMUST00000106215 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Snx8-201ENSMUST00000031539 2627 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Pdzd11-202ENSMUST00000059099 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm26755-201ENSMUST00000180703 2657 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Enah-205ENSMUST00000177811 4231 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.02■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Gm26917-202ENSMUST00000192833 3329 ntBASIC27.01■■□□□ 1.92
Ccdc180J3QNE4 Hspa1b-201ENSMUST00000172753 2803 ntAPPRIS P1 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Atp4b-201ENSMUST00000033826 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gpx3-201ENSMUST00000082430 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Ftl1-201ENSMUST00000094434 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Tbp-202ENSMUST00000117593 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Elovl1-201ENSMUST00000006557 1811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Ecm1-201ENSMUST00000029753 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Peli2-201ENSMUST00000073150 5900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Kcnh2-202ENSMUST00000115098 3193 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Pex11g-202ENSMUST00000111081 666 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Taf11-201ENSMUST00000025057 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Rec114-201ENSMUST00000098674 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Cdc42se2-201ENSMUST00000064104 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 P2ry6-201ENSMUST00000060174 1946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Cd63-ps-201ENSMUST00000145417 875 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Rapsn-203ENSMUST00000111446 1458 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Pola2-201ENSMUST00000025752 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Spidr-201ENSMUST00000040248 3279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Prrx2-202ENSMUST00000113592 1070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Cd47-201ENSMUST00000084838 5277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Lamp2-203ENSMUST00000074913 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Mettl7a3-201ENSMUST00000075420 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm12446-202ENSMUST00000152069 713 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm19265-201ENSMUST00000201818 894 ntTSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Prr23a2-201ENSMUST00000071302 881 ntAPPRIS P1 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Rpn2-201ENSMUST00000029171 2621 ntTSL 5 BASIC26.98■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm10814-201ENSMUST00000180505 1933 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Pqlc1-204ENSMUST00000129043 1864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Adk-207ENSMUST00000224069 1818 ntAPPRIS ALT1 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm14928-201ENSMUST00000120198 477 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Nudcd2-203ENSMUST00000127382 727 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 1700016P03Rik-201ENSMUST00000134252 863 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm13568-201ENSMUST00000156099 446 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm43433-201ENSMUST00000196573 481 ntBASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Cndp2-202ENSMUST00000168419 2088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Hps1-201ENSMUST00000026194 2647 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 BC034090-204ENSMUST00000186156 4873 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Rnf26-208ENSMUST00000185479 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Bcam-201ENSMUST00000003061 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Pkp2-202ENSMUST00000161342 2931 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Skida1-201ENSMUST00000066885 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Gm5108-201ENSMUST00000177891 543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Ccdc180J3QNE4 Trappc4-201ENSMUST00000034623 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.1 ms