Protein–RNA interactions for Protein: J3QN38

Gm21972, Predicted gene 21972 (Fragment), mousemouse

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Length 98 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm21972J3QN38 Tmem128-201ENSMUST00000087511 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Fam169b-202ENSMUST00000125685 2821 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Slc8a3-201ENSMUST00000064594 4379 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Usp13-201ENSMUST00000072312 7580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Yap1-201ENSMUST00000065353 4171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm27528-202ENSMUST00000222916 2012 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Pdlim7-206ENSMUST00000131306 1915 ntTSL 2 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rnf40-202ENSMUST00000205694 5279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Ercc2-203ENSMUST00000108461 2799 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 4933427J07Rik-201ENSMUST00000156275 1533 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Usp33-201ENSMUST00000026507 4153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Trim39-203ENSMUST00000113706 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 2810402E24Rik-201ENSMUST00000190699 3040 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rtn4-205ENSMUST00000102843 4618 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm14066-201ENSMUST00000134801 2057 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Mob1a-202ENSMUST00000055261 4412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rev3l-201ENSMUST00000019986 10713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Elovl6-205ENSMUST00000199910 2610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Nid2-201ENSMUST00000022340 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm4793-201ENSMUST00000067468 2616 ntTSL 2 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Abhd16b-201ENSMUST00000069649 1775 ntAPPRIS P1 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Cacnb2-202ENSMUST00000114719 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Cadps2-209ENSMUST00000142913 4533 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Ppil3-204ENSMUST00000117069 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Mark2-201ENSMUST00000025921 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Coro1c-201ENSMUST00000004646 3491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Kcnc2-201ENSMUST00000092175 5046 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Ccdc115-201ENSMUST00000042493 1705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Nup205-204ENSMUST00000201374 6411 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Zbtb5-201ENSMUST00000055028 4316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gtf3c4-201ENSMUST00000037117 6941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Slc22a1-201ENSMUST00000024596 1994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Trim54-202ENSMUST00000202769 1408 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Tlr2-201ENSMUST00000029623 3014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Itga3-203ENSMUST00000120375 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm43796-201ENSMUST00000202853 2012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Spon2-201ENSMUST00000046186 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Men1-204ENSMUST00000113500 2742 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.12□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Kmt2e-201ENSMUST00000094962 7252 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Reep1-201ENSMUST00000121469 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Ulk1-211ENSMUST00000200299 3581 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Dysf-201ENSMUST00000081904 6660 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Pigb-207ENSMUST00000184389 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Pigv-201ENSMUST00000062118 3979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Tspan11-201ENSMUST00000032501 5188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Kctd14-204ENSMUST00000205577 2310 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rab34-201ENSMUST00000002128 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm31774-201ENSMUST00000212910 1366 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Nlrp6-204ENSMUST00000184560 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gdf10-201ENSMUST00000168727 5210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Lman1-202ENSMUST00000120461 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Sbno2-204ENSMUST00000217972 2462 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Mettl7a1-201ENSMUST00000067752 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm13312-201ENSMUST00000119631 718 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Plekha4-207ENSMUST00000211227 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 AC130713.1-201ENSMUST00000228853 1096 ntBASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Ube3b-201ENSMUST00000074002 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Nynrin-202ENSMUST00000168479 7511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Fam20a-201ENSMUST00000020938 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Strip2-201ENSMUST00000046028 5370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Zfp568-203ENSMUST00000148442 4005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Mier2-212ENSMUST00000172158 1400 ntTSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Dst-213ENSMUST00000183302 8788 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.11□□□□□ -0.31
Gm21972J3QN38 Abhd3-203ENSMUST00000117828 1962 ntTSL 1 (best) BASIC13.11□□□□□ -0.31
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