Protein–RNA interactions for Protein: J3QMS8

Gm3415, Predicted gene 3415, mousemouse

Predictions only

Length 315 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3415J3QMS8 Armc9-205ENSMUST00000131412 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Trim62-201ENSMUST00000035667 3752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rfx5-207ENSMUST00000137088 4333 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 BC005537-201ENSMUST00000019276 5849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cyp2f2-201ENSMUST00000003100 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Zglp1-201ENSMUST00000115494 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rpl36-ps8-201ENSMUST00000121187 315 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Tamm41-201ENSMUST00000032461 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Grin3b-201ENSMUST00000045085 3283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 4921539H07Rik-202ENSMUST00000200072 1665 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 A430035B10Rik-204ENSMUST00000148063 2010 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Amz2-202ENSMUST00000092500 2816 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Stpg1-201ENSMUST00000063707 2380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Cmtm1-202ENSMUST00000160596 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Furin-203ENSMUST00000122232 4286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Myo9b-201ENSMUST00000071935 7082 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Hnrnpm-205ENSMUST00000139302 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rfc5-201ENSMUST00000086461 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Dmkn-202ENSMUST00000054427 2034 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sardhos-201ENSMUST00000170435 265 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Spr-ps1-202ENSMUST00000186281 706 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm43514-201ENSMUST00000198852 424 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rrp8-201ENSMUST00000033179 3053 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Tbc1d2-202ENSMUST00000107750 1941 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Hectd2-201ENSMUST00000047247 4731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Ppp1r15b-201ENSMUST00000052529 5594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Htatip2-201ENSMUST00000085272 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Zbtb46-205ENSMUST00000180222 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Tfap2a-203ENSMUST00000223869 2037 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Vav1-204ENSMUST00000169220 2810 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Mtg2-201ENSMUST00000087563 1346 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gsg1-201ENSMUST00000087729 1307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Endod1-201ENSMUST00000167549 4470 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Sirt5-203ENSMUST00000220576 1579 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Pcp2-205ENSMUST00000142431 524 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Grtp1-201ENSMUST00000165605 1271 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Retsat-204ENSMUST00000176168 1203 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm27525-201ENSMUST00000184465 107 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Gm3415J3QMS8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Slk-202ENSMUST00000051691 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Uck2-202ENSMUST00000053686 4731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Mylk2-201ENSMUST00000028970 2951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm12866-201ENSMUST00000128998 1671 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Hoga1-201ENSMUST00000081714 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Foxp2-207ENSMUST00000115477 6760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Slc39a11-203ENSMUST00000106633 2688 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Cnksr3-201ENSMUST00000015346 3447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Zpbp2-204ENSMUST00000107511 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Thop1-201ENSMUST00000005057 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Irf1-201ENSMUST00000019043 2069 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Anxa3-201ENSMUST00000031447 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Zfp606-201ENSMUST00000098822 4748 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm5366-201ENSMUST00000215494 1338 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Tdrd7-201ENSMUST00000102929 3716 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm29361-201ENSMUST00000183323 2000 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Eml3-202ENSMUST00000224272 2978 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Cd164l2-201ENSMUST00000105910 986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Ankrd65-202ENSMUST00000165000 1140 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 1500015A07Rik-203ENSMUST00000184678 890 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 1810008I18Rik-201ENSMUST00000185464 2419 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Steap2-205ENSMUST00000115427 3470 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Dhx34-203ENSMUST00000119102 4310 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Arid4b-201ENSMUST00000039538 5844 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Gm3415J3QMS8 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.7 ms