Protein–RNA interactions for Protein: J3QJX6

7530416G11Rik, RIKEN cDNA 7530416G11 gene, mousemouse

Predictions only

Length 159 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
7530416G11RikJ3QJX6 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC9.39□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Rundc1-201ENSMUST00000040561 3223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tbr1-201ENSMUST00000048934 3977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.39□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Bptf-202ENSMUST00000106762 11847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tfap2a-202ENSMUST00000110193 2863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Elmod1-201ENSMUST00000048409 2605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Abtb2-201ENSMUST00000076212 4558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Nek8-201ENSMUST00000017549 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Brd3-203ENSMUST00000113941 5289 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Osbpl8-202ENSMUST00000105275 7204 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm18244-201ENSMUST00000219747 1566 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Pcolce-202ENSMUST00000054564 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mast2-201ENSMUST00000003908 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Rnf168-201ENSMUST00000014218 3932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tmbim6-201ENSMUST00000023749 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Plagl1-202ENSMUST00000121646 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Pdk2-201ENSMUST00000038431 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kdm6a-201ENSMUST00000044484 5918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kdm6a-202ENSMUST00000052368 5935 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mir2861-201ENSMUST00000175539 82 ntBASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Fam50b-201ENSMUST00000039605 1229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gnb5-201ENSMUST00000076889 1188 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cbs-203ENSMUST00000118504 2401 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Rab11fip2-201ENSMUST00000051996 4482 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ero1lb-202ENSMUST00000220811 3341 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr153-203ENSMUST00000105651 3777 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Srrm1-203ENSMUST00000105861 3797 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gpr153-201ENSMUST00000055754 3757 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm26860-201ENSMUST00000181674 1489 ntTSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgap42-203ENSMUST00000183182 1458 ntTSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Atg16l1-202ENSMUST00000113186 3004 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sema4a-214ENSMUST00000166237 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Vrtn-201ENSMUST00000095551 3028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Olfr742-202ENSMUST00000213935 2117 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ube2d2b-201ENSMUST00000072578 1678 ntAPPRIS P1 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem30a-201ENSMUST00000034878 3658 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Dhrs3-206ENSMUST00000154208 2337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sipa1-201ENSMUST00000071857 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Hoxb1-201ENSMUST00000019117 2086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Igsf9b-202ENSMUST00000133213 4239 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Fstl4-201ENSMUST00000036796 4380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.38□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb20-201ENSMUST00000079441 3086 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 AC164702.1-201ENSMUST00000220135 2212 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Lmod3-201ENSMUST00000095655 2215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Pex16-201ENSMUST00000028650 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Tmem200a-201ENSMUST00000066049 4115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Dmtn-208ENSMUST00000228009 2643 ntAPPRIS P2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Inpp4a-209ENSMUST00000140264 3676 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Erfe-201ENSMUST00000086861 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Lrp8os3-201ENSMUST00000125464 1770 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 9330182L06Rik-202ENSMUST00000115348 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Zfp354a-202ENSMUST00000102766 2592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Arhgef17-201ENSMUST00000107032 10190 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Grk6-205ENSMUST00000224653 2976 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Psd-210ENSMUST00000225323 3398 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Catsper4-204ENSMUST00000169381 1506 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Mrpl49-201ENSMUST00000007482 1722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 4921514A10Rik-201ENSMUST00000181450 2114 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Kcnh4-201ENSMUST00000107361 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 B230206H07Rik-202ENSMUST00000134845 3269 ntTSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Iqce-202ENSMUST00000077890 2494 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Sdf4-203ENSMUST00000105578 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Rab11fip1-202ENSMUST00000054212 7965 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Rps16-201ENSMUST00000082134 1109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ap2a1-201ENSMUST00000085399 3442 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc157-202ENSMUST00000101626 5153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cacna1g-207ENSMUST00000107789 8383 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cpn1-201ENSMUST00000026210 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Fgf15-201ENSMUST00000033389 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ppip5k2-202ENSMUST00000112845 6239 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Nol9-201ENSMUST00000084116 3722 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ltbp4-201ENSMUST00000038618 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Gm15082-201ENSMUST00000147045 1960 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Myt1l-204ENSMUST00000218198 2735 ntTSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Zbtb46-201ENSMUST00000029106 5309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Snx19-201ENSMUST00000164099 5762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cpq-201ENSMUST00000042167 1923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Ccdc157-201ENSMUST00000093381 5015 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.37□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cdk5rap3-201ENSMUST00000103152 2250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Cep19-202ENSMUST00000115168 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Eif5-202ENSMUST00000166123 4050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.36□□□□□ -0.91
7530416G11RikJ3QJX6 Pik3cd-214ENSMUST00000177654 4765 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC9.36□□□□□ -0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46.1 ms