Protein–RNA interactions for Protein: G5E8Z2

Taf4b, Transcription initiation factor TFIID subunit 4B, mousemouse

Predictions only

Length 855 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4bG5E8Z2 Gm13597-201ENSMUST00000121239 375 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm12981-201ENSMUST00000131733 622 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 AC164567.1-201ENSMUST00000219185 960 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gapdh-201ENSMUST00000073605 1272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Sp8-201ENSMUST00000063918 4478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Car10-205ENSMUST00000107861 2613 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Syt3-201ENSMUST00000118831 2627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ocrl-201ENSMUST00000001202 5253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Synrg-207ENSMUST00000183456 3990 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 4930459C07Rik-202ENSMUST00000219638 1805 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Wt1-201ENSMUST00000111098 2395 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Fbxw2-205ENSMUST00000113078 1872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Crtc3-201ENSMUST00000122255 5115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Taf4bG5E8Z2 Ptpn6-210ENSMUST00000174265 1743 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm10710-201ENSMUST00000047876 3971 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Elf3-202ENSMUST00000185752 1901 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Fndc3a-201ENSMUST00000089017 6143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rufy3-205ENSMUST00000198965 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Hhat-201ENSMUST00000044190 2839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Ctdp1-201ENSMUST00000036229 3713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Susd3-202ENSMUST00000058196 1418 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Smox-208ENSMUST00000110188 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Chd4-201ENSMUST00000056889 6697 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Hs3st5-201ENSMUST00000058738 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Dnajc8-206ENSMUST00000105940 772 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 2200002J24Rik-201ENSMUST00000013227 333 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm20878-206ENSMUST00000153997 903 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Zfp865-201ENSMUST00000076251 7503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Zfp879-202ENSMUST00000109133 2229 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Cct7-201ENSMUST00000032078 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Unc5a-201ENSMUST00000026994 3995 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Strn4-202ENSMUST00000108495 3082 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 1600014C10Rik-208ENSMUST00000179525 2326 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tle2-205ENSMUST00000135211 2746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Pmpca-201ENSMUST00000076431 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tvp23b-201ENSMUST00000014321 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Mbtps2-201ENSMUST00000058098 4797 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 B3gnt5-202ENSMUST00000119468 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Nfat5-203ENSMUST00000125721 5899 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Necab3-201ENSMUST00000000895 1829 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 C920006O11Rik-201ENSMUST00000180974 1444 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Prrt2-201ENSMUST00000159916 2501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Cyb5rl-204ENSMUST00000106760 840 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm26769-201ENSMUST00000180469 619 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm5177-201ENSMUST00000183092 997 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm27301-201ENSMUST00000184012 127 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm44945-201ENSMUST00000206764 1187 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Thap2-203ENSMUST00000218989 527 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Ppp1r37-201ENSMUST00000058444 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Klk15-201ENSMUST00000068625 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Mast3-201ENSMUST00000166004 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Arap3-201ENSMUST00000042944 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Mis18a-201ENSMUST00000099554 1333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rfx5-202ENSMUST00000107253 4367 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Zfp13-201ENSMUST00000057029 2139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rps6kb2-202ENSMUST00000118483 1409 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Adgrl1-210ENSMUST00000152978 5734 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Safb-201ENSMUST00000095224 3106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Dnase2a-201ENSMUST00000003910 1715 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tacstd2-201ENSMUST00000058178 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Zbed5-201ENSMUST00000041466 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Aimp2-202ENSMUST00000100483 1073 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Gm28308-201ENSMUST00000128102 752 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Tpd52l1-202ENSMUST00000213528 969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Pts-206ENSMUST00000214873 511 ntTSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Aimp2-201ENSMUST00000031613 1185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 BC031181-201ENSMUST00000040284 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Midn-202ENSMUST00000099492 3597 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Bag4-201ENSMUST00000038498 4876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Zfp212-201ENSMUST00000009411 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 E330009J07Rik-202ENSMUST00000101492 6742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Il11ra1-202ENSMUST00000108040 1837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Cyb5r1-201ENSMUST00000027726 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Nprl3-201ENSMUST00000020530 2865 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Taf4bG5E8Z2 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 42.7 ms