Protein–RNA interactions for Protein: G5E8X0

Cldn20, Claudin, mousemouse

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cldn20G5E8X0 Fam228b-201ENSMUST00000053458 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ankrd61-202ENSMUST00000110717 1498 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rasal3-207ENSMUST00000137458 3272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Kcnq1-201ENSMUST00000009689 3029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Hic2-201ENSMUST00000090190 6354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Adam10-201ENSMUST00000067880 4593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Slc2a6-202ENSMUST00000102890 1887 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ap4b1-202ENSMUST00000076599 2692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Fbxo27-202ENSMUST00000108280 2031 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tinf2-205ENSMUST00000227842 2001 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Dnajb2-210ENSMUST00000188931 3066 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cblb-201ENSMUST00000114471 6648 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Mfsd3-201ENSMUST00000019224 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm42743-201ENSMUST00000051089 1511 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Arhgap4-204ENSMUST00000114406 2749 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm3248-201ENSMUST00000163885 2055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Sirt7-202ENSMUST00000106183 427 ntTSL 3 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cldn7-204ENSMUST00000108597 913 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 4930451I11Rik-201ENSMUST00000061695 481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tbx15-201ENSMUST00000029462 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 AC166574.6-201ENSMUST00000227889 1806 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Babam1-201ENSMUST00000002473 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 B4galnt1-201ENSMUST00000006914 2395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm38197-201ENSMUST00000192320 2122 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gstm4-201ENSMUST00000029489 1707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tsc2-205ENSMUST00000226398 5459 ntAPPRIS P2 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Il2rb-202ENSMUST00000163494 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 1300014J16Rik-201ENSMUST00000219015 1337 ntBASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 2810039B14Rik-201ENSMUST00000183928 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Pex1-202ENSMUST00000121291 4555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.1□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Aqp3-201ENSMUST00000055327 1765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Ly9-201ENSMUST00000004827 2098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rad54l2-201ENSMUST00000046502 9305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Clptm1-201ENSMUST00000055242 4143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Iffo1-202ENSMUST00000119527 2840 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Shd-201ENSMUST00000044216 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Suv39h1-203ENSMUST00000115638 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Fnbp1-208ENSMUST00000113560 4726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Safb2-201ENSMUST00000075510 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Phkg2-202ENSMUST00000121004 1840 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cd72-202ENSMUST00000098104 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Klk12-202ENSMUST00000107970 1115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Anks1-203ENSMUST00000114842 5610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Zscan10-204ENSMUST00000118369 1006 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm15234-201ENSMUST00000141485 1058 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 BC051226-201ENSMUST00000172526 837 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 4732463B04Rik-201ENSMUST00000180751 2932 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm17807-201ENSMUST00000186869 298 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Vegfc-203ENSMUST00000210831 555 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm35154-202ENSMUST00000217008 1093 ntTSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Tgfbr2-202ENSMUST00000061101 8092 ntTSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Asb16-201ENSMUST00000036467 2843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm6858-201ENSMUST00000208582 1468 ntBASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 1700029J07Rik-201ENSMUST00000095323 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Arhgef5-201ENSMUST00000031750 5469 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.09□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 AC166491.1-201ENSMUST00000227053 2308 ntBASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Crb2-201ENSMUST00000050372 6372 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Gm10125-203ENSMUST00000161096 3493 ntTSL 3 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Cspg5-204ENSMUST00000197850 7868 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.31
Cldn20G5E8X0 Plxnc1-201ENSMUST00000099337 7302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Alg10b-201ENSMUST00000100309 3727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Rab17-204ENSMUST00000131428 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Emd-201ENSMUST00000002029 1595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ghrhr-201ENSMUST00000063578 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pla2g16-203ENSMUST00000136756 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Snx14-204ENSMUST00000165315 3109 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Krtap1-4-201ENSMUST00000100479 593 ntAPPRIS P1 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Mocs1-202ENSMUST00000165390 729 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 AC153794.1-201ENSMUST00000169148 126 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 AC114585.2-202ENSMUST00000228094 426 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ppm1m-201ENSMUST00000076258 1811 ntTSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Pcdh7-202ENSMUST00000094783 3752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Rbm34-201ENSMUST00000045994 3424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ubxn11-201ENSMUST00000070246 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 AC132265.1-201ENSMUST00000219233 1665 ntBASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Ptprt-202ENSMUST00000109442 7719 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Tmx4-201ENSMUST00000038228 5488 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Islr-202ENSMUST00000168864 2076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
Cldn20G5E8X0 Zfp821-203ENSMUST00000212000 2081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.08□□□□□ -0.32
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