Protein–RNA interactions for Protein: G5E8V9

Arfip1, ADP-ribosylation factor-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 373 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arfip1G5E8V9 Pptc7-202ENSMUST00000119015 2233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Dsn1-201ENSMUST00000103129 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Glg1-204ENSMUST00000169020 7021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Arfip1G5E8V9 Akirin2-201ENSMUST00000084299 1397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ccdc43-205ENSMUST00000164506 2316 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Uxs1-202ENSMUST00000126008 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Sfta3-ps-205ENSMUST00000220379 2187 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 E530011L22Rik-201ENSMUST00000181325 5282 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Slc27a5-202ENSMUST00000120903 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Otud4-202ENSMUST00000173078 7354 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Vps37c-201ENSMUST00000087951 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Slpi-201ENSMUST00000109367 876 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Mtif3-203ENSMUST00000110564 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Mtif3-204ENSMUST00000110566 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Cops9-202ENSMUST00000112999 653 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm4995-201ENSMUST00000117247 432 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Pfn2-203ENSMUST00000120289 905 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Evx1-202ENSMUST00000129243 1034 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 H2-Bl-211ENSMUST00000195838 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Higd1a-206ENSMUST00000215300 605 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Khk-201ENSMUST00000031053 1257 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Lce1f-201ENSMUST00000047153 728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 C1qtnf2-201ENSMUST00000057679 1211 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ifitm10-201ENSMUST00000059223 3412 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Eml5-210ENSMUST00000223282 7595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Adgrb2-205ENSMUST00000106017 5104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ntf3-202ENSMUST00000112244 1399 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Jph4-202ENSMUST00000124493 3200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Arhgef2-202ENSMUST00000107510 4390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Cyb5r3-201ENSMUST00000018186 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Otop3-201ENSMUST00000019006 2422 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Fam81a-201ENSMUST00000034749 3703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Rell1-204ENSMUST00000154169 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Grm4-201ENSMUST00000118161 4537 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Nfat5-211ENSMUST00000151114 4982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Mccc2-201ENSMUST00000022148 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Nucb1-201ENSMUST00000033096 2111 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Kbtbd2-201ENSMUST00000114321 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Narfl-201ENSMUST00000002350 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Kdelc2-201ENSMUST00000037853 3642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Cdkn1a-203ENSMUST00000122348 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm11615-201ENSMUST00000156205 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm20509-201ENSMUST00000174203 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 1700030N18Rik-201ENSMUST00000202497 966 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 AC121788.1-202ENSMUST00000218801 871 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 CT030684.1-201ENSMUST00000227292 914 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Prss29-201ENSMUST00000024993 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 1700021F07Rik-201ENSMUST00000029023 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm11960-202ENSMUST00000181063 2858 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ercc1-201ENSMUST00000003645 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Papolb-201ENSMUST00000099400 4239 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ccdc13-202ENSMUST00000135986 2640 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Ephb4-201ENSMUST00000061244 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Zfp868-202ENSMUST00000121886 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Fbxl8-201ENSMUST00000036221 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Slc25a22-201ENSMUST00000019226 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Brap-201ENSMUST00000031414 3744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Dlg5-202ENSMUST00000073687 7784 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Casp8ap2-201ENSMUST00000029950 6799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Pitx2-203ENSMUST00000106382 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm43352-201ENSMUST00000196419 3065 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Olah-201ENSMUST00000027955 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Phospho2-201ENSMUST00000028494 2260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Prss41-204ENSMUST00000151797 1743 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Spopl-203ENSMUST00000132484 6595 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 March8-201ENSMUST00000079012 4450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Sema3b-202ENSMUST00000102529 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Fgfr1op2-204ENSMUST00000111663 2880 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Aig1-202ENSMUST00000105534 617 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 E130218I03Rik-203ENSMUST00000125921 666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 E130218I03Rik-206ENSMUST00000135228 544 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Bnipl-204ENSMUST00000137250 1251 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 E130218I03Rik-207ENSMUST00000143448 591 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 2310061I04Rik-204ENSMUST00000148721 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm37935-201ENSMUST00000192012 982 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Klrg2-202ENSMUST00000201345 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Arfip1G5E8V9 Gm44123-201ENSMUST00000204662 577 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.8 ms