Protein–RNA interactions for Protein: G5E8G2

Usp17ld, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 17-like protein D, mousemouse

Predictions only

Length 545 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp17ldG5E8G2 Gm45552-201ENSMUST00000209340 778 ntTSL 3 BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Isca2-201ENSMUST00000021667 883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 AC238811.1-201ENSMUST00000225302 441 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Snx24-201ENSMUST00000025417 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Smim8-201ENSMUST00000029972 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Il31-201ENSMUST00000031389 806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Vps25-202ENSMUST00000042477 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cenpm-201ENSMUST00000089155 1109 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Pabpn1l-201ENSMUST00000093059 1148 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ube2j2-201ENSMUST00000024056 3483 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Elmo2-203ENSMUST00000094329 3466 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Mindy2-201ENSMUST00000049031 8081 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Insig1-201ENSMUST00000059155 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cdk2-201ENSMUST00000026415 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Shd-202ENSMUST00000223629 1430 ntAPPRIS P2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Zbtb7c-201ENSMUST00000058997 4569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Psmc3-202ENSMUST00000067663 1636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Shroom3-204ENSMUST00000168878 5630 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Zkscan17-202ENSMUST00000101150 3771 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Mob4-202ENSMUST00000159311 1816 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Slc9a3r1-201ENSMUST00000021077 1925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Dnase1l1-203ENSMUST00000114189 755 ntTSL 3 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Mrps24-205ENSMUST00000154330 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 2900022M07Rik-201ENSMUST00000193912 1017 ntBASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Rsph9-201ENSMUST00000024762 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Foxp4-202ENSMUST00000113262 3198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ntf3-201ENSMUST00000050484 1483 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Iqsec2-202ENSMUST00000112604 5967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Rasgrp1-201ENSMUST00000102534 5229 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Map1s-201ENSMUST00000019405 3314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Rb1-201ENSMUST00000022701 4656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Zfp446-204ENSMUST00000108537 2178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Otol1-201ENSMUST00000053013 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Rbfox2-204ENSMUST00000171751 3558 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Klk8-201ENSMUST00000085461 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm13233-201ENSMUST00000118760 1443 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm13244-201ENSMUST00000118855 1446 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Pdpk1-201ENSMUST00000052462 1832 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Zfp384-207ENSMUST00000112427 3072 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Trim11-201ENSMUST00000093061 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cradd-201ENSMUST00000053594 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Ecsit-201ENSMUST00000098937 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Cdpf1-202ENSMUST00000125947 706 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm833-201ENSMUST00000143133 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 1700029H14Rik-204ENSMUST00000151400 1216 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm10535-201ENSMUST00000182275 915 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Lrcol1-202ENSMUST00000185691 764 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 1700072B07Rik-201ENSMUST00000191141 445 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm37748-201ENSMUST00000194379 1140 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm18018-201ENSMUST00000198273 408 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Prok2-204ENSMUST00000203738 695 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Crybb2-201ENSMUST00000031295 724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Fbxo15-204ENSMUST00000224467 1908 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Hpcal4-202ENSMUST00000106246 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Chac1-201ENSMUST00000028780 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Robo3-202ENSMUST00000115038 4797 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Usp17ldG5E8G2 Gm5320-201ENSMUST00000207163 1519 ntBASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 I0C0044D17Rik-201ENSMUST00000097964 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Slc6a11-201ENSMUST00000032451 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Fmr1-205ENSMUST00000114656 4257 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Rab11fip5-202ENSMUST00000204087 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Fbrsl1-202ENSMUST00000069483 4720 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Ube2j2-213ENSMUST00000166489 3339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Spg21-201ENSMUST00000034955 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Emc8-201ENSMUST00000034277 4942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Gm24543-201ENSMUST00000103867 82 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Pisd-ps1-201ENSMUST00000119128 1115 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Tmem80-205ENSMUST00000132061 667 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Snu13-203ENSMUST00000166578 1061 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Gm43630-201ENSMUST00000201550 776 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Calml4-201ENSMUST00000034777 864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Akr1b7-201ENSMUST00000007449 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Oser1-202ENSMUST00000104954 1702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Snap91-204ENSMUST00000098495 4150 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Arfgap2-202ENSMUST00000080008 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Aim2-204ENSMUST00000166137 2079 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Ablim2-202ENSMUST00000101280 3042 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Gm42466-201ENSMUST00000202099 1301 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Tmem150b-202ENSMUST00000086364 2822 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Plbd2-201ENSMUST00000031597 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Arfgap1-214ENSMUST00000185115 1393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Mul1-203ENSMUST00000105815 473 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Bola2-202ENSMUST00000106369 642 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Nmi-202ENSMUST00000112705 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Usp17ldG5E8G2 Fcnb-202ENSMUST00000117486 873 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.4 ms