Protein–RNA interactions for Protein: G5E8C1

Vmn1r67, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 305 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r67G5E8C1 Etl4-207ENSMUST00000114610 2863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Sema3b-204ENSMUST00000102531 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm5478-201ENSMUST00000100184 2566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm16183-201ENSMUST00000127527 1193 ntTSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm12497-201ENSMUST00000138778 237 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Pmf1-205ENSMUST00000193338 795 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Tecr-201ENSMUST00000019382 1158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Jagn1-202ENSMUST00000204254 1147 ntTSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Syce1l-204ENSMUST00000212269 753 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Cmtm5-203ENSMUST00000227441 610 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Ube2t-201ENSMUST00000027687 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Irf3-201ENSMUST00000003284 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rasal3-204ENSMUST00000135618 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Kif1c-203ENSMUST00000102554 6684 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rflna-203ENSMUST00000197746 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Ggn-205ENSMUST00000209019 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm45546-201ENSMUST00000211053 2394 ntBASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Nt5e-201ENSMUST00000034992 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Ptpn6-203ENSMUST00000171549 2226 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Sept4-201ENSMUST00000018544 1726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Sacs-201ENSMUST00000089394 3345 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Sp2-203ENSMUST00000107624 3055 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Moxd1-201ENSMUST00000095784 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Hnf1a-201ENSMUST00000031535 3191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.16□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Fgf9-201ENSMUST00000022545 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Foxp1-208ENSMUST00000113329 1926 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Pom121l2-202ENSMUST00000117882 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Alpl-201ENSMUST00000030551 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Eomes-201ENSMUST00000035020 3560 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rnaseh2a-203ENSMUST00000109738 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Nup88-202ENSMUST00000108530 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Ddx39-202ENSMUST00000109810 1794 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Txndc11-203ENSMUST00000118679 3523 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Bag6-201ENSMUST00000025250 3858 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Sirt5-206ENSMUST00000221481 1548 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Carlr-201ENSMUST00000181515 2574 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Men1-206ENSMUST00000113502 2652 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm43195-201ENSMUST00000200614 2332 ntBASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Gm15510-201ENSMUST00000123644 1172 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Smim1-205ENSMUST00000131325 842 ntTSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 AC133183.1-201ENSMUST00000221229 429 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rhog-201ENSMUST00000098230 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Dlg5-203ENSMUST00000090398 7851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Twsg1-201ENSMUST00000024906 4046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Hs3st3b1-201ENSMUST00000094103 4911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Zcchc3-201ENSMUST00000099207 3073 ntAPPRIS P1 BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Mms22l-201ENSMUST00000050446 4261 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.3
Vmn1r67G5E8C1 Rgs3-204ENSMUST00000107420 2752 ntTSL 1 (best) BASIC13.15□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Vps53-201ENSMUST00000056601 2833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Mpp3-201ENSMUST00000062801 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Pbx3-201ENSMUST00000040638 2587 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Cgn-202ENSMUST00000107273 5016 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Dnajc6-202ENSMUST00000094953 5322 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Mef2b-201ENSMUST00000110140 1223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Mef2b-202ENSMUST00000110141 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Gm7284-201ENSMUST00000131667 944 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Fam163b-201ENSMUST00000151224 2959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Stx3-208ENSMUST00000211641 1018 ntTSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 AC108846.1-201ENSMUST00000214531 513 ntBASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Prss40-201ENSMUST00000047840 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Hbb-bt-201ENSMUST00000098192 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Syne3-201ENSMUST00000067005 5097 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Gm4756-202ENSMUST00000208039 2344 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Inha-201ENSMUST00000037330 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Scube1-201ENSMUST00000016907 3991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Lrp11-203ENSMUST00000130590 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Khdrbs1-201ENSMUST00000066257 3738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Kdm6b-201ENSMUST00000094077 6654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.14□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Hsd3b7-202ENSMUST00000106271 1713 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 A430034D21Rik-201ENSMUST00000194339 1802 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Patz1-201ENSMUST00000057089 3118 ntTSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Oxtr-201ENSMUST00000053306 4704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Cdkn2aip-202ENSMUST00000212175 3393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Fbxl12-205ENSMUST00000140702 1555 ntBASIC13.13□□□□□ -0.31
Vmn1r67G5E8C1 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.13□□□□□ -0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms