Protein–RNA interactions for Protein: G3X9Z4

Pcf11, Cleavage and polyadenylation factor subunit homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Predictions only

Length 1,553 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcf11G3X9Z4 Gm9522-201ENSMUST00000182394 926 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 AC123645.1-201ENSMUST00000228469 605 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Kxd1-201ENSMUST00000093456 1216 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 2900055J20Rik-201ENSMUST00000096572 723 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Plin5-201ENSMUST00000019808 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Pld3-202ENSMUST00000117611 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Utp4-201ENSMUST00000047629 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Mapk14-204ENSMUST00000114754 3592 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ldb3-207ENSMUST00000227819 1499 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Spdef-202ENSMUST00000114870 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Tex44-201ENSMUST00000046004 1724 ntAPPRIS P1 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm10110-201ENSMUST00000081204 1891 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gtf2a2-202ENSMUST00000118198 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm12490-201ENSMUST00000120255 560 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm21887-201ENSMUST00000178789 441 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Hsd17b14-205ENSMUST00000210300 797 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm5519-201ENSMUST00000042061 513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ap4b1-207ENSMUST00000200377 1823 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Cachd1-201ENSMUST00000030257 5765 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ccdc154-202ENSMUST00000182292 1989 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Chst10-201ENSMUST00000027249 2975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Ptp4a2-207ENSMUST00000165853 3382 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Foxl2-201ENSMUST00000051312 3256 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm13034-201ENSMUST00000121342 3177 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Nme1-202ENSMUST00000107844 452 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm15491-201ENSMUST00000133963 751 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm42612-201ENSMUST00000197986 623 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm43170-201ENSMUST00000199827 612 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 AC151971.1-201ENSMUST00000217329 993 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Mt1-201ENSMUST00000034215 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Tlcd2-201ENSMUST00000043598 1153 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Mpc1-201ENSMUST00000046754 920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Cited1-201ENSMUST00000050551 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Hist1h3b-201ENSMUST00000091703 620 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Adipor1-201ENSMUST00000027727 3123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Gm16565-201ENSMUST00000159138 2181 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Dhrs1-201ENSMUST00000002403 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Wdr73-201ENSMUST00000026816 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Pcf11G3X9Z4 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Mospd3-202ENSMUST00000111007 1318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Eif2a-201ENSMUST00000029387 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Aldh1b1-201ENSMUST00000044384 2298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Chaf1b-202ENSMUST00000117099 1894 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 G3bp2-209ENSMUST00000202258 1884 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 E130201H02Rik-201ENSMUST00000123576 851 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Med10-204ENSMUST00000221893 815 ntTSL 2 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Mrps21-202ENSMUST00000072587 405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Synrg-201ENSMUST00000049714 3995 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Clcc1-201ENSMUST00000029483 2224 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Spns1-203ENSMUST00000119846 2017 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Fam171a1-204ENSMUST00000115099 4149 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gjb3-202ENSMUST00000106091 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Galnt17-202ENSMUST00000160609 2875 ntTSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Phyhip-201ENSMUST00000003561 2838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Pbk-201ENSMUST00000022612 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Pacsin2-203ENSMUST00000171436 3693 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Lenep-201ENSMUST00000057431 1806 ntAPPRIS P1 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Ppia-206ENSMUST00000213200 1450 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Trnt1-204ENSMUST00000113249 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gamt-202ENSMUST00000105363 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 B9d2-202ENSMUST00000205325 593 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Phgr1-201ENSMUST00000061360 538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm20445-201ENSMUST00000061905 565 ntBASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Lhx3-201ENSMUST00000028302 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Klc4-201ENSMUST00000003642 2322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Arhgef9-219ENSMUST00000199920 1976 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Prrxl1-203ENSMUST00000187377 1629 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Slc8b1-202ENSMUST00000076051 2661 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Comtd1-202ENSMUST00000124549 2314 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Sf3a2-204ENSMUST00000151928 781 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 1700055C04Rik-201ENSMUST00000176450 355 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 AA619741-201ENSMUST00000195095 646 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm45059-201ENSMUST00000205558 1077 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Trim68-205ENSMUST00000210855 2301 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Gm7390-201ENSMUST00000212452 1216 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Mobp-207ENSMUST00000215512 498 ntTSL 2 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Pcf11G3X9Z4 Palb2-201ENSMUST00000063587 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.5 ms