Protein–RNA interactions for Protein: G3X9U3

Vmn1r58, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r58G3X9U3 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 2310039H08Rik-201ENSMUST00000071430 773 ntAPPRIS P1 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rnf44-201ENSMUST00000037422 3734 ntTSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Sytl1-202ENSMUST00000105908 1730 ntTSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Clpb-202ENSMUST00000106998 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Aim2-202ENSMUST00000147604 2839 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cry2-202ENSMUST00000111278 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Kcnma1-214ENSMUST00000190044 3747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Acbd5-215ENSMUST00000228050 4804 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Mtfr2-201ENSMUST00000169712 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm128-201ENSMUST00000090815 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gdpd2-202ENSMUST00000113744 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Spg20-204ENSMUST00000118118 3981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.38□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 4632404H12Rik-201ENSMUST00000038450 2791 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Raver1-202ENSMUST00000217282 4234 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Slc20a2-201ENSMUST00000067786 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Klhdc3-201ENSMUST00000071841 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Dhodh-201ENSMUST00000123605 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Iqgap1-201ENSMUST00000167377 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Mon1a-202ENSMUST00000191906 2821 ntTSL 2 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Nfe2l1-204ENSMUST00000107659 2351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fzd7-201ENSMUST00000114246 4532 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Adamts20-201ENSMUST00000035342 6027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Pank4-201ENSMUST00000030931 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rnf123-201ENSMUST00000047746 4722 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm33142-201ENSMUST00000193913 867 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm42477-201ENSMUST00000202427 469 ntTSL 3 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tctex1d4-201ENSMUST00000062206 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Nkx2-6-201ENSMUST00000062437 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fbrs-202ENSMUST00000205432 4166 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rrp1b-201ENSMUST00000081339 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Prdm10-202ENSMUST00000117389 1952 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Kcnk6-201ENSMUST00000085818 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Klc2-201ENSMUST00000025798 2940 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Zfp740-201ENSMUST00000118729 4241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cnksr2-202ENSMUST00000112513 4471 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tex13b-201ENSMUST00000044179 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 E230016M11Rik-201ENSMUST00000130657 1764 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fars2-208ENSMUST00000224611 1750 ntAPPRIS P1 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Fgd4-211ENSMUST00000162671 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Crhr2-203ENSMUST00000114374 1440 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm26840-201ENSMUST00000180784 2980 ntTSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Spns1-202ENSMUST00000119754 2001 ntTSL 5 BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Lmna-203ENSMUST00000120377 2021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Cdt1-201ENSMUST00000006760 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC13.37□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Iws1-206ENSMUST00000212675 2936 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Adamts7-201ENSMUST00000113059 5379 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rtkn-202ENSMUST00000087938 3080 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hpn-201ENSMUST00000039435 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Actg1-202ENSMUST00000071555 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Noct-203ENSMUST00000167780 2992 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ylpm1-207ENSMUST00000168977 4893 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ntn4-201ENSMUST00000020204 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rnf150-201ENSMUST00000078525 9682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 S100pbp-204ENSMUST00000106061 4426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gpr146-201ENSMUST00000051293 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Slc24a3-201ENSMUST00000081121 1788 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rab11b-203ENSMUST00000173860 1544 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Bud23-202ENSMUST00000085984 1516 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm14859-201ENSMUST00000117752 357 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 BC048679-203ENSMUST00000207871 567 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Abcc5-203ENSMUST00000096199 1136 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ash2l-201ENSMUST00000068892 3307 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Itga3-201ENSMUST00000001548 4861 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Radil-201ENSMUST00000063635 3700 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Hs3st1-201ENSMUST00000053116 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rbm47-201ENSMUST00000094756 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Arf1-201ENSMUST00000061242 1800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Csnk1g2-202ENSMUST00000085435 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Kcnip4-201ENSMUST00000087395 2366 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Rnf217-201ENSMUST00000081989 11013 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ebag9-202ENSMUST00000226165 1931 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Ap4b1-201ENSMUST00000047285 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Dnmt3b-201ENSMUST00000056495 4318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gid8-201ENSMUST00000029090 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 B3gnt3-201ENSMUST00000034260 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Prnd-202ENSMUST00000110170 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Vmn1r58G3X9U3 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.3 ms