Protein–RNA interactions for Protein: G3X9C2

Nccrp1, F-box only protein 50, mousemouse

Predictions only

Length 266 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nccrp1G3X9C2 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Galnt2-201ENSMUST00000034458 4113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Lck-202ENSMUST00000102596 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Meig1-203ENSMUST00000115082 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Gm45683-201ENSMUST00000210825 1247 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Plpp2-205ENSMUST00000218241 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 1500035N22Rik-201ENSMUST00000075081 865 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Strn4-201ENSMUST00000019220 3535 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Kmt5c-202ENSMUST00000108582 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
Nccrp1G3X9C2 Fam133b-205ENSMUST00000197082 1943 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Aaed1-207ENSMUST00000222570 3011 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Prdm4-207ENSMUST00000220032 3962 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Sirt4-202ENSMUST00000112067 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tnip2-203ENSMUST00000114359 1642 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tcf3-201ENSMUST00000020377 2842 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Synj2-210ENSMUST00000115791 5051 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Arntl2-204ENSMUST00000111639 2923 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm17018-201ENSMUST00000047057 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ttc9c-201ENSMUST00000088092 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Zfp358-203ENSMUST00000208423 2200 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Samm50-201ENSMUST00000023071 1673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm38058-201ENSMUST00000194323 4368 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Foxg1-204ENSMUST00000179669 3973 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Fam208b-201ENSMUST00000096069 8338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Olfr55-201ENSMUST00000112168 948 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tmsb4x-202ENSMUST00000112175 864 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Fhad1os2-201ENSMUST00000152351 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm29456-201ENSMUST00000189894 768 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 AC160980.1-201ENSMUST00000224136 970 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tnp2-201ENSMUST00000051297 549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rpl28-202ENSMUST00000078432 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 9430015G10Rik-208ENSMUST00000169550 2660 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ptprv-210ENSMUST00000183317 6108 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Hbegf-201ENSMUST00000025363 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm17501-201ENSMUST00000181247 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Kank2-201ENSMUST00000034717 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Podn-203ENSMUST00000106709 3170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Supt5-208ENSMUST00000209141 3755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Kdm4b-202ENSMUST00000086835 4360 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Adam9-202ENSMUST00000084035 3985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Edem2-201ENSMUST00000040833 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Pqlc1-203ENSMUST00000123750 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Fam126b-201ENSMUST00000038372 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ggnbp2-211ENSMUST00000168434 3056 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Sympk-201ENSMUST00000023882 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ppip5k2-201ENSMUST00000042509 5882 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Fubp3-201ENSMUST00000055244 3648 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Syt6-201ENSMUST00000090697 4416 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Arap2-201ENSMUST00000076623 7306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Josd2-202ENSMUST00000117324 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm24513-201ENSMUST00000174964 138 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tma7-203ENSMUST00000192801 386 ntTSL 3 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm44492-201ENSMUST00000197012 141 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Fam71e1-204ENSMUST00000205422 366 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Nxnl2-201ENSMUST00000021828 1167 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Rabggta-205ENSMUST00000227061 2882 ntAPPRIS P1 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ephb2-201ENSMUST00000059287 4804 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Vsig10-202ENSMUST00000111967 4236 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Zkscan3-203ENSMUST00000116434 2600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tm9sf1-204ENSMUST00000121937 2398 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Arid4b-203ENSMUST00000110534 5864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 4933421O10Rik-201ENSMUST00000155691 3847 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Pxk-205ENSMUST00000225653 2765 ntAPPRIS P2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Mybl1-201ENSMUST00000088658 4980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Phb2-201ENSMUST00000004375 1318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Elmo2-202ENSMUST00000074046 3502 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tpbg-201ENSMUST00000006559 3603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Bclaf3-201ENSMUST00000057180 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Sigirr-201ENSMUST00000097958 1990 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Fam69c-201ENSMUST00000052501 2153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Atp6v0d1-201ENSMUST00000013304 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 6030419C18Rik-202ENSMUST00000216294 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Synm-202ENSMUST00000074233 7818 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Naa10-203ENSMUST00000114387 979 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm16151-201ENSMUST00000129696 639 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Fam241b-208ENSMUST00000142796 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm8318-201ENSMUST00000182954 872 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm27397-201ENSMUST00000184997 107 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gsdmcl2-204ENSMUST00000186026 736 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gsdmcl1-202ENSMUST00000190937 735 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Tspyl-ps-201ENSMUST00000220692 1117 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 AC159295.1-201ENSMUST00000225326 940 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Pdlim4-202ENSMUST00000093109 962 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Nccrp1G3X9C2 Ppp3cb-201ENSMUST00000022355 3074 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45.8 ms