Protein–RNA interactions for Protein: F8VQM8

Xntrpc, Xndc1-transient receptor potential cation channel, subfamily C, member 2 readthrough, mousemouse

Predictions only

Length 1,264 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XntrpcF8VQM8 Cpxm1-201ENSMUST00000028897 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Prkab1-202ENSMUST00000111999 2026 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Galt-202ENSMUST00000108038 1859 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Pcdha3-201ENSMUST00000192503 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Slfnl1-201ENSMUST00000062990 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Fgfr4-201ENSMUST00000005452 3324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Lat2-201ENSMUST00000036362 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Arl6-202ENSMUST00000099646 1554 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 1700010B13Rik-202ENSMUST00000189435 1549 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Slc24a4-202ENSMUST00000159329 4465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Tmem37-201ENSMUST00000056089 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm6973-201ENSMUST00000117080 721 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Rps13-ps4-201ENSMUST00000117927 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Rps13-ps5-201ENSMUST00000117939 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Tpm3-203ENSMUST00000119158 1090 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm15483-201ENSMUST00000120338 456 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm15593-201ENSMUST00000122085 1008 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm17455-201ENSMUST00000164428 855 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 1700021A07Rik-203ENSMUST00000188024 404 ntTSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Slc12a5-208ENSMUST00000202479 1202 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Vmn2r-ps89-201ENSMUST00000209195 1010 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Nmur1-202ENSMUST00000212058 1287 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Dnal1-201ENSMUST00000046340 790 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Pcna-ps2-201ENSMUST00000088040 1257 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Cxxc5-201ENSMUST00000060722 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Chrna4-202ENSMUST00000108851 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Ppp1r2-201ENSMUST00000060188 4078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Pcbp3-201ENSMUST00000001148 2013 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Anapc2-201ENSMUST00000028341 3004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Tnfaip2-201ENSMUST00000102745 3762 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Myod1-201ENSMUST00000072514 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Sorbs1-213ENSMUST00000225153 3589 ntAPPRIS P4 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Comt-202ENSMUST00000115609 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Men1-203ENSMUST00000079327 2639 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Dock1-206ENSMUST00000211593 2589 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Atp8b2-210ENSMUST00000168276 4265 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Tbx3-202ENSMUST00000079719 4982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Jup-202ENSMUST00000107403 2386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Foxi1-201ENSMUST00000060271 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm36445-203ENSMUST00000209951 1597 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Slc37a4-203ENSMUST00000213388 2344 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm27198-201ENSMUST00000184172 1517 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Pimreg-201ENSMUST00000021164 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 BC037039-201ENSMUST00000192003 2205 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Pcsk6-201ENSMUST00000055576 4405 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Zfp800-202ENSMUST00000115320 4311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Lrrc7-204ENSMUST00000199890 6326 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Rhcg-201ENSMUST00000032766 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm34016-201ENSMUST00000222678 1384 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Celf5-203ENSMUST00000120508 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm11839-201ENSMUST00000120647 1953 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Fignl2-202ENSMUST00000213610 4462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Tmsb10-203ENSMUST00000114050 570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Slc36a3os-201ENSMUST00000155883 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm8597-201ENSMUST00000191525 1109 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm40123-201ENSMUST00000198175 1027 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm43767-201ENSMUST00000198933 381 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Trip6-203ENSMUST00000199121 366 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm38554-201ENSMUST00000201639 708 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm43125-201ENSMUST00000201724 730 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm5312-201ENSMUST00000203728 547 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 AC154621.1-201ENSMUST00000226155 1119 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Pde6g-201ENSMUST00000026452 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Atp6v0b-201ENSMUST00000036380 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Asl-205ENSMUST00000161094 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Adam23-201ENSMUST00000087374 6426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Xpo1-202ENSMUST00000102869 6004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm20482-201ENSMUST00000172746 1644 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Slc39a11-202ENSMUST00000071539 2664 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm8096-201ENSMUST00000209921 1591 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Zfyve27-201ENSMUST00000099443 2573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Casc3-201ENSMUST00000017384 3963 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Dcun1d3-203ENSMUST00000106519 1475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Ctage5-213ENSMUST00000176464 4434 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Zfp395-201ENSMUST00000066994 4229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Tulp2-205ENSMUST00000107762 1883 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Klk10-201ENSMUST00000014058 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Trip10-202ENSMUST00000224152 1812 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Col16a1-201ENSMUST00000044565 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Atf7ip2-202ENSMUST00000100191 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gm12017-201ENSMUST00000122453 1003 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Runx2os2-201ENSMUST00000161664 818 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 2810047C21Rik1-201ENSMUST00000172930 915 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Nnat-209ENSMUST00000173793 386 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Lactbl1-201ENSMUST00000178843 2954 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Atf5-203ENSMUST00000209072 595 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 AC166341.4-201ENSMUST00000220625 123 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 AC139382.1-201ENSMUST00000221402 498 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Gal3st1-203ENSMUST00000109981 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Esrp1-202ENSMUST00000108310 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Pld4-201ENSMUST00000063888 1982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
XntrpcF8VQM8 Ntng2-204ENSMUST00000102873 1593 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms