Protein–RNA interactions for Protein: F7CQW8

Gm3371, Predicted gene 3371 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 167 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm3371F7CQW8 Smtnl1-201ENSMUST00000028471 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ncf1-205ENSMUST00000144086 2882 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ube2j1-202ENSMUST00000124992 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Usp30-201ENSMUST00000031588 4604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 9630013D21Rik-204ENSMUST00000156790 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Hdgfl1-201ENSMUST00000055915 1993 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Sphk1-211ENSMUST00000141798 1532 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Zmynd11-204ENSMUST00000110635 3881 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Usp27x-203ENSMUST00000191497 4273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Rasgrp2-205ENSMUST00000113471 535 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Plpp7-202ENSMUST00000140762 634 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm16838-201ENSMUST00000144594 816 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Rps2-ps5-201ENSMUST00000184266 849 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm30097-202ENSMUST00000194580 329 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 AC154222.1-201ENSMUST00000223882 475 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Chchd2-201ENSMUST00000094280 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 D930028M14Rik-201ENSMUST00000098678 1003 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tmc8-203ENSMUST00000117781 2344 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Zpbp-201ENSMUST00000020413 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 B230217C12Rik-203ENSMUST00000164364 1859 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Atl1-201ENSMUST00000021466 5150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Pcdha4-202ENSMUST00000192512 5363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Actn3-201ENSMUST00000006626 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Usp4-201ENSMUST00000035237 3662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ano8-201ENSMUST00000093450 3653 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Nptn-201ENSMUST00000085651 2024 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ccdc137-201ENSMUST00000058370 2778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Dennd1a-201ENSMUST00000102787 4342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ecel1-203ENSMUST00000160810 2898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Rnf122-205ENSMUST00000217278 1726 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 6430710C18Rik-203ENSMUST00000136807 1540 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ppp2r1b-211ENSMUST00000176798 2074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Slc39a13-202ENSMUST00000079976 1884 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ccdc154-201ENSMUST00000073277 2417 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ada-201ENSMUST00000017841 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Slc7a15-204ENSMUST00000165657 1467 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Slc7a15-202ENSMUST00000095863 1467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm45799-202ENSMUST00000106786 409 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Rpl13-ps5-201ENSMUST00000117813 630 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 1700017L05Rik-201ENSMUST00000201654 558 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Kitl-202ENSMUST00000105283 5648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Sirpa-203ENSMUST00000103202 3982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Chd1l-201ENSMUST00000029730 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Zfp444-201ENSMUST00000054680 2467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Casz1-202ENSMUST00000122222 7926 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Map3k14-201ENSMUST00000021324 4246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm8237-201ENSMUST00000164484 2051 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Clstn1-202ENSMUST00000105691 4459 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tox2-202ENSMUST00000109428 2947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Nr1i3-203ENSMUST00000111328 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Lhx3-202ENSMUST00000054099 2184 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Hnrnpr-202ENSMUST00000105850 2683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Trmt6-201ENSMUST00000039554 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Stap2-201ENSMUST00000043785 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Spatc1-201ENSMUST00000074173 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tesk2-203ENSMUST00000106459 2444 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 AC122901.1-201ENSMUST00000214203 1790 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Mrc2-202ENSMUST00000100335 5795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tmod2-208ENSMUST00000215614 1921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Col8a2-201ENSMUST00000070132 4332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ralgds-203ENSMUST00000113893 3683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Atp6v0b-208ENSMUST00000150204 935 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm16160-201ENSMUST00000160105 781 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Caly-202ENSMUST00000166758 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Erdr1-202ENSMUST00000177671 708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ap2s1-204ENSMUST00000205607 372 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm45091-201ENSMUST00000205799 504 ntTSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Rnf7-202ENSMUST00000071301 334 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Dnajb12-201ENSMUST00000020309 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Pde4d-204ENSMUST00000117879 1724 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Oas1a-201ENSMUST00000080322 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gm5096-201ENSMUST00000091776 1858 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Dsel-201ENSMUST00000035462 5759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Emp2-201ENSMUST00000078357 3440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Macrod2-201ENSMUST00000043836 3552 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Sybu-201ENSMUST00000090057 3230 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ppp4r4-201ENSMUST00000021631 3964 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Ahctf1-201ENSMUST00000027768 8506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Trmt1-201ENSMUST00000001974 2567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Acd-201ENSMUST00000042608 3154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Gpd1l-204ENSMUST00000146623 4391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Tchh-201ENSMUST00000064257 5823 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Cdadc1-204ENSMUST00000171683 1892 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Gm3371F7CQW8 Dek-201ENSMUST00000021807 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.7 ms