Protein–RNA interactions for Protein: F6XLV1

Crocc2, Ciliary rootlet coiled-coil, rootletin family member 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,638 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Crocc2F6XLV1 Gm29127-201ENSMUST00000188304 517 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ighv1-25-201ENSMUST00000195638 345 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Gm5425-201ENSMUST00000214125 459 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Degs2-201ENSMUST00000021691 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Tmem86b-201ENSMUST00000055085 1222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ccni-201ENSMUST00000058550 2804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Chit1-201ENSMUST00000086475 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ush1c-207ENSMUST00000176371 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Bnip2-201ENSMUST00000034754 2464 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ddc-201ENSMUST00000066237 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Gm4959-201ENSMUST00000197271 1044 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 9430007M09Rik-201ENSMUST00000201947 804 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Gm10570-201ENSMUST00000097865 513 ntAPPRIS P1 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Pdia4-201ENSMUST00000077290 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ccdc43-201ENSMUST00000092569 2366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Gna15-201ENSMUST00000043709 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Cpne6-203ENSMUST00000165262 2178 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Tmco4-202ENSMUST00000050949 3318 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Fiz1-202ENSMUST00000165320 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Prss45-201ENSMUST00000011391 1232 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Gm11814-201ENSMUST00000119515 929 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ube2i-205ENSMUST00000172587 508 ntTSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Gm29154-230ENSMUST00000215044 1165 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Aqp8-201ENSMUST00000033023 1487 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Tdg-201ENSMUST00000092266 2959 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 1600020E01Rik-207ENSMUST00000204738 1997 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Ldha-214ENSMUST00000210815 1535 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Crocc2F6XLV1 Relt-201ENSMUST00000008462 2851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm10275-202ENSMUST00000168697 495 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm8652-201ENSMUST00000181363 964 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 4930500L23Rik-201ENSMUST00000198000 747 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 2810047C21Rik1-202ENSMUST00000210322 1179 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm10275-201ENSMUST00000092620 635 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm18222-201ENSMUST00000202416 1387 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Sept1-202ENSMUST00000106314 1486 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Wdr1-205ENSMUST00000201260 2139 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Slain1-201ENSMUST00000069443 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Car15-201ENSMUST00000118960 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Nudt17-202ENSMUST00000171249 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm27572-201ENSMUST00000183702 255 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Fxyd1-217ENSMUST00000206860 594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Tssc1-207ENSMUST00000222407 489 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Krtap6-5-201ENSMUST00000074637 600 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Arf2-202ENSMUST00000063347 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Fhl2-202ENSMUST00000185893 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Ablim2-203ENSMUST00000114203 1333 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Nat3-201ENSMUST00000070514 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Kalrn-208ENSMUST00000114961 6128 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Spcs2-ps-201ENSMUST00000122326 682 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Pisd-ps2-202ENSMUST00000142526 1175 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 2210408F21Rik-214ENSMUST00000155345 1022 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm27514-201ENSMUST00000183692 110 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm7561-201ENSMUST00000211203 886 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Prss38-201ENSMUST00000061481 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Tmem101-201ENSMUST00000021296 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Hira-202ENSMUST00000120532 2063 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm11684-201ENSMUST00000144975 757 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm28942-201ENSMUST00000186334 365 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 2310040G24Rik-202ENSMUST00000189386 775 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm11562-201ENSMUST00000073853 817 ntAPPRIS P1 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Tex13c3-201ENSMUST00000089246 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Dera-207ENSMUST00000203693 1446 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Tcf3-202ENSMUST00000020379 2829 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 AL645783.1-201ENSMUST00000221416 1832 ntBASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Gm40765-201ENSMUST00000218612 1469 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Zmym3-208ENSMUST00000121429 1890 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Nap1l1-203ENSMUST00000217908 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Crocc2F6XLV1 Shh-201ENSMUST00000002708 2847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 39.8 ms