Protein–RNA interactions for Protein: F6U8B9

Gm17555, Predicted gene, 17555, mousemouse

Predictions only

Length 371 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm17555F6U8B9 Mtss1-201ENSMUST00000080371 4938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Atp2a3-201ENSMUST00000021142 4593 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Dnmt3b-202ENSMUST00000072997 4208 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Cope-201ENSMUST00000066469 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Nyap1-204ENSMUST00000212152 2499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Hyou1-201ENSMUST00000066601 4432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Psmd4-203ENSMUST00000117355 1756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Uhrf1bp1l-201ENSMUST00000020112 6448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Sh2b3-204ENSMUST00000122426 2777 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Grwd1-202ENSMUST00000131384 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Cspp1-205ENSMUST00000122156 2535 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Sigirr-203ENSMUST00000209294 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Emilin3-201ENSMUST00000057169 3547 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Plod2-201ENSMUST00000070522 3649 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Carmil3-201ENSMUST00000076236 4602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Cttn-202ENSMUST00000103079 3286 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 0610025J13Rik-203ENSMUST00000180374 713 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Msh3-205ENSMUST00000187424 666 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Vsig2-201ENSMUST00000002008 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Fcnb-201ENSMUST00000028179 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 AU040320-201ENSMUST00000047431 4384 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Kdm8-201ENSMUST00000033010 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Sync-201ENSMUST00000102599 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Ush1g-201ENSMUST00000103037 3306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Tchp-201ENSMUST00000094441 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Wnt11-201ENSMUST00000067495 3451 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Pard3-222ENSMUST00000162536 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.91□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Dmtn-202ENSMUST00000022695 4080 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Lix1l-201ENSMUST00000062058 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Sorbs3-204ENSMUST00000227929 2460 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Rtn1-201ENSMUST00000021497 1544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Ctnnb1-201ENSMUST00000007130 3623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Kcnf1-201ENSMUST00000170580 4789 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Anks1b-205ENSMUST00000179694 2663 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Gm2061-201ENSMUST00000180623 2761 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Mettl7a2-202ENSMUST00000176287 1800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Mettl7a2-201ENSMUST00000088142 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Slc46a3-202ENSMUST00000118527 2210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Fnip2-201ENSMUST00000076136 3775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 L2hgdh-201ENSMUST00000021370 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Tmem178b-203ENSMUST00000180886 712 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Ten1-201ENSMUST00000021130 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Tomm22-201ENSMUST00000023062 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Nmu-201ENSMUST00000031146 828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Apof-201ENSMUST00000050901 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Cd302-202ENSMUST00000074606 1354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Pcdh10-204ENSMUST00000193252 4638 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Ren1-201ENSMUST00000094556 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Rxrg-203ENSMUST00000111384 1967 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Ccdc158-203ENSMUST00000150359 3353 ntTSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Hic1-201ENSMUST00000055619 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Plekha1-203ENSMUST00000120441 3777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Papd5-203ENSMUST00000119033 4624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Gng2-204ENSMUST00000160013 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Large2-203ENSMUST00000111284 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Ush1c-202ENSMUST00000078680 2047 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Hmgb3-204ENSMUST00000114582 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Hmgb3-203ENSMUST00000088874 1728 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
Gm17555F6U8B9 Bud23-201ENSMUST00000071677 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Kif7-204ENSMUST00000184137 4093 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Klhl21-201ENSMUST00000097773 3986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Tle1-204ENSMUST00000102848 3660 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Large2-202ENSMUST00000090582 2291 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Tmem110-201ENSMUST00000006701 3742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Camk1g-204ENSMUST00000169907 1968 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Coq6-202ENSMUST00000110276 1776 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Nhs-202ENSMUST00000087085 8805 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Gins2-201ENSMUST00000034278 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Cldn7-203ENSMUST00000108596 664 ntTSL 3 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Gmnn-202ENSMUST00000110382 963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Gm7153-201ENSMUST00000117092 455 ntBASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Gm12963-201ENSMUST00000131846 783 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 BC048679-202ENSMUST00000144156 640 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Hs3st2-202ENSMUST00000206880 1149 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Fuz-206ENSMUST00000207485 1140 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Pabpn1l-202ENSMUST00000212966 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Gpsm1-203ENSMUST00000078616 3127 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Stard7-201ENSMUST00000110374 1530 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Cds1-201ENSMUST00000031273 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Rcbtb1-202ENSMUST00000043227 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Proser2-202ENSMUST00000114942 4398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Midn-201ENSMUST00000042057 3727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Flt4-201ENSMUST00000020617 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 0610005C13Rik-207ENSMUST00000210866 2434 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Pmm1-201ENSMUST00000023112 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Scyl3-207ENSMUST00000170359 4288 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Ubb-201ENSMUST00000019649 1499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Dr1-201ENSMUST00000031190 3085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Dnaja3-201ENSMUST00000060067 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Dcakd-201ENSMUST00000021313 1744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Yif1b-203ENSMUST00000108238 1126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Gm12134-201ENSMUST00000122109 520 ntBASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Mras-203ENSMUST00000122384 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Gm14964-202ENSMUST00000149574 716 ntTSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
Gm17555F6U8B9 Gm15246-201ENSMUST00000149873 540 ntTSL 3 BASIC13.88□□□□□ -0.19
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 47.2 ms