Protein–RNA interactions for Protein: F6SEU4

Syngap1, Ras/Rap GTPase-activating protein SynGAP, mousemouse

Predictions only

Length 1,340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngap1F6SEU4 Hsd17b4-201ENSMUST00000025385 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Chst8-201ENSMUST00000078686 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Dok2-201ENSMUST00000022698 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Ubqln4-201ENSMUST00000008748 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Adcy3-207ENSMUST00000152065 4728 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mapk8ip3-201ENSMUST00000088345 5543 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 2610206C17Rik-201ENSMUST00000129059 1717 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Lbp-201ENSMUST00000016168 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Dlgap3-202ENSMUST00000106092 2901 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Celf1-206ENSMUST00000111451 4678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tmx4-203ENSMUST00000110120 2602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm5779-201ENSMUST00000218467 910 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Cd302-201ENSMUST00000028356 1257 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Fam170b-201ENSMUST00000104926 1694 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Mrps2-201ENSMUST00000038600 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Casp2-201ENSMUST00000031895 3529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Gm5357-201ENSMUST00000212720 1924 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Spag16-201ENSMUST00000065425 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Kctd8-201ENSMUST00000054095 2859 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Lrrc57-202ENSMUST00000102497 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Tmem229b-201ENSMUST00000056660 3860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Sntb2-201ENSMUST00000047425 3225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Pds5b-208ENSMUST00000202170 6598 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Jade1-203ENSMUST00000168086 4790 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Rabepk-203ENSMUST00000118108 1431 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 AC124751.1-201ENSMUST00000222716 1408 ntBASIC16.83■□□□□ 0.29
Syngap1F6SEU4 Lcn5-203ENSMUST00000100313 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm13453-201ENSMUST00000118708 357 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm16215-201ENSMUST00000161990 637 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 AC131710.1-201ENSMUST00000228336 990 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Rnf145-201ENSMUST00000019333 3570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm13425-201ENSMUST00000145389 5391 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Dctd-201ENSMUST00000033966 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Cyb561a3-201ENSMUST00000168445 1474 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Pnliprp2-201ENSMUST00000026081 1567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 App-207ENSMUST00000227737 2827 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Lrch3-210ENSMUST00000170201 2902 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Sfmbt1-201ENSMUST00000054230 7837 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Nrip2-201ENSMUST00000001561 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Prodh2-201ENSMUST00000058280 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Snx1-201ENSMUST00000034946 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ccbe1-202ENSMUST00000130300 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Cobl-203ENSMUST00000109651 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 1700121C08Rik-201ENSMUST00000137546 677 ntTSL 3 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm7286-201ENSMUST00000182691 1007 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm8602-201ENSMUST00000184045 607 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 AY702102-202ENSMUST00000194651 1173 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Neurl2-201ENSMUST00000042775 1014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm9945-201ENSMUST00000067523 932 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Zbtb11-201ENSMUST00000050248 4920 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 0610010F05Rik-203ENSMUST00000109532 4106 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Pou5f1-201ENSMUST00000025271 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Dynlt1c-201ENSMUST00000092966 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Fus-203ENSMUST00000106251 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Hist3h2a-201ENSMUST00000108817 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Twf2-201ENSMUST00000024047 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Foxp4-201ENSMUST00000097311 3197 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Slc25a29-201ENSMUST00000021693 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Nes-201ENSMUST00000090973 6126 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Tcf3-203ENSMUST00000105339 2096 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 D930048G16Rik-201ENSMUST00000180975 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Fgf2-208ENSMUST00000200585 5973 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Yes1-205ENSMUST00000202543 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Rnf13-205ENSMUST00000198214 2027 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ifngr1-201ENSMUST00000020188 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm10501-201ENSMUST00000151136 2200 ntTSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Cdyl2-201ENSMUST00000109102 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Syt6-202ENSMUST00000117221 4394 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Mvp-202ENSMUST00000165096 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gtf3c4-204ENSMUST00000171404 7127 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Hoxa13-202ENSMUST00000114416 769 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Klk11-202ENSMUST00000171458 1260 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Armc12-201ENSMUST00000025060 1083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Myl6b-201ENSMUST00000026428 1026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Galnt6os-201ENSMUST00000160960 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Ndufv1-201ENSMUST00000042497 1661 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Lrrc56-203ENSMUST00000084446 2390 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Mapk8ip2-201ENSMUST00000023291 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Rarg-202ENSMUST00000063339 2718 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Hsd17b12-201ENSMUST00000028619 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 R3hcc1-201ENSMUST00000118374 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Prrg2-208ENSMUST00000210690 1623 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Gcsh-201ENSMUST00000040484 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 1700113H08Rik-201ENSMUST00000169849 1332 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.81■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Fgf13-201ENSMUST00000033473 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Syngap1F6SEU4 Acadvl-202ENSMUST00000102574 2168 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 51.6 ms