Protein–RNA interactions for Protein: F6RGI3

Gm340, Predicted gene 340, mousemouse

Predictions only

Length 1,242 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm340F6RGI3 Dmkn-203ENSMUST00000085688 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Senp6-202ENSMUST00000164859 3853 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.07
Gm340F6RGI3 Fbln1-202ENSMUST00000109432 2273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Clgn-202ENSMUST00000109831 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Stk11-202ENSMUST00000105370 1474 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Slc30a5-201ENSMUST00000067246 3179 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Tmem161a-214ENSMUST00000182980 2080 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Zmym3-204ENSMUST00000118092 1502 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Clns1a-201ENSMUST00000026506 1504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Cdc37l1-204ENSMUST00000224511 2944 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Otop3-202ENSMUST00000106543 2369 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Sdhb-201ENSMUST00000010007 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mir5131-201ENSMUST00000175426 93 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Tnnt2-205ENSMUST00000178204 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Tnnt2-207ENSMUST00000179863 1097 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Tnnt2-209ENSMUST00000188028 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Pard6a-204ENSMUST00000212352 1234 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm40513-201ENSMUST00000217258 411 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Lrr1-203ENSMUST00000222520 767 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rnf114-202ENSMUST00000109214 3001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Olfr317-203ENSMUST00000216196 2781 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Arid1b-202ENSMUST00000115797 11325 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Serinc1-201ENSMUST00000020027 2880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm28111-201ENSMUST00000187786 1393 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Fam83g-202ENSMUST00000093019 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Penk-201ENSMUST00000070375 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Ythdf3-202ENSMUST00000108346 4929 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm16425-201ENSMUST00000118143 3130 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Zfp24-203ENSMUST00000153337 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Map3k5-202ENSMUST00000120259 4289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Osbpl8-201ENSMUST00000095310 3622 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gnat1-201ENSMUST00000010205 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Usp43-201ENSMUST00000021288 4462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rbmx-206ENSMUST00000143310 1296 ntTSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm32050-201ENSMUST00000209793 638 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mzt1-203ENSMUST00000227948 952 ntBASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Myl12b-201ENSMUST00000038446 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Dnajc28-201ENSMUST00000049244 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm26732-201ENSMUST00000181807 2771 ntTSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Fdx1-202ENSMUST00000214013 2759 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Traf5-201ENSMUST00000085573 1964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Kcnma1-228ENSMUST00000224468 3753 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Fbxo41-202ENSMUST00000161078 6562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Cfap69-205ENSMUST00000135252 2188 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 D430041D05Rik-201ENSMUST00000089726 10124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mrpl58-202ENSMUST00000103036 749 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm11185-201ENSMUST00000117732 1007 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm14722-201ENSMUST00000118943 689 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm13403-202ENSMUST00000134271 674 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Stard3nl-208ENSMUST00000200323 1128 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Pcdha11-201ENSMUST00000115658 5359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Lipo3-202ENSMUST00000112508 2839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Pccb-201ENSMUST00000035116 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Pnn-201ENSMUST00000021381 3485 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Fbxo5-201ENSMUST00000019907 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Llgl1-201ENSMUST00000052346 4303 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mus81-202ENSMUST00000124334 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Ikzf5-202ENSMUST00000121033 2231 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rhpn1-202ENSMUST00000121137 2283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Tmem198b-201ENSMUST00000051011 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Hnrnpm-201ENSMUST00000087582 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mkrn3-201ENSMUST00000094340 2547 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gfm2-211ENSMUST00000161913 1829 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rassf5-203ENSMUST00000112442 3388 ntTSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 3110082I17Rik-204ENSMUST00000198474 2030 ntTSL 2 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Yod1-201ENSMUST00000049813 6128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Hrh3-204ENSMUST00000165248 1224 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gm19710-202ENSMUST00000200320 493 ntTSL 3 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 AC147366.1-201ENSMUST00000227671 852 ntBASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Mrps18a-201ENSMUST00000024763 884 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Cort-201ENSMUST00000030815 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 2210406O10Rik-201ENSMUST00000044964 937 ntTSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Olfr30-201ENSMUST00000055204 1066 ntAPPRIS P1 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Csrnp1-203ENSMUST00000214058 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Zfp385a-201ENSMUST00000168828 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Cybrd1-201ENSMUST00000028403 5339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Tpgs2-202ENSMUST00000148255 3424 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Majin-202ENSMUST00000113528 1562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Slc25a21-201ENSMUST00000044634 2609 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Gyg-203ENSMUST00000178328 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Fgfr3-203ENSMUST00000114411 4225 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.55□□□□□ -0.08
Gm340F6RGI3 Sidt2-201ENSMUST00000038488 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.55□□□□□ -0.08
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