Protein–RNA interactions for Protein: E9QAP7

Taf4, TATA-box-binding protein-associated factor 4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,042 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf4E9QAP7 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Diaph2-207ENSMUST00000167619 8439 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Slc43a3-201ENSMUST00000090726 2583 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Hoxd12-201ENSMUST00000001878 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Akt2-202ENSMUST00000085917 1392 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Ovol2-202ENSMUST00000103171 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Wt1-202ENSMUST00000111099 2441 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Prkcz2-201ENSMUST00000206136 1756 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Arl4a-201ENSMUST00000101472 1200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Gm12973-201ENSMUST00000143967 607 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Gm11750-201ENSMUST00000146016 583 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Gm25406-201ENSMUST00000157599 105 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Timm13-201ENSMUST00000020440 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Ppil1-201ENSMUST00000024802 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Mrpl17-201ENSMUST00000033170 1028 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Ric8b-201ENSMUST00000038523 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Ndufb10-201ENSMUST00000045602 732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Cyp2u1-201ENSMUST00000106337 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Rfx5-203ENSMUST00000107254 4450 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Alx1-204ENSMUST00000217946 1542 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Arid5a-208ENSMUST00000137906 5504 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Rbfox3-205ENSMUST00000117731 3084 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Usp20-202ENSMUST00000102849 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Ralbp1-201ENSMUST00000024905 3765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Tpm1-215ENSMUST00000113705 1759 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Klhl9-201ENSMUST00000094993 4174 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Flywch1-202ENSMUST00000086325 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Tfeb-201ENSMUST00000024786 2296 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Fstl1-201ENSMUST00000114763 3789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Efemp2-204ENSMUST00000165485 1557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Sgta-202ENSMUST00000218208 1964 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Wfikkn1-201ENSMUST00000095487 1981 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Gm14261-201ENSMUST00000145105 1429 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Gm15998-201ENSMUST00000135144 1844 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Trmt112-202ENSMUST00000116551 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Ascl5-201ENSMUST00000180436 567 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Sbsn-202ENSMUST00000182227 432 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Sbsn-203ENSMUST00000182229 732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Fam26f-201ENSMUST00000062784 1094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 6030408B16Rik-201ENSMUST00000071328 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Romo1-201ENSMUST00000088610 569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Mmp28-203ENSMUST00000108137 2451 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Cacna2d3-201ENSMUST00000022567 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Ndufv2-203ENSMUST00000143987 1540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Hpcal1-201ENSMUST00000071858 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Gm13127-201ENSMUST00000118978 1389 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
Taf4E9QAP7 Kif12-201ENSMUST00000030042 2250 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Plch2-212ENSMUST00000186598 2119 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gdf3-201ENSMUST00000032211 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gpr155-202ENSMUST00000076463 5061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 4933433G15Rik-201ENSMUST00000180533 1481 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Tmem108-204ENSMUST00000189588 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Kdm5c-202ENSMUST00000112584 5900 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Map6-203ENSMUST00000122101 3233 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Bnipl-202ENSMUST00000107195 1810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Dnajc2-203ENSMUST00000115193 2416 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Scrt1-201ENSMUST00000096365 4010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Pax7-201ENSMUST00000030508 5854 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Nlrx1-203ENSMUST00000169651 3621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Col1a1-201ENSMUST00000001547 5930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm4609-201ENSMUST00000106443 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Klk6-202ENSMUST00000107967 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm5138-201ENSMUST00000113842 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm15191-201ENSMUST00000117933 1000 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm12182-201ENSMUST00000118655 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm13882-201ENSMUST00000120886 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Psmc4-206ENSMUST00000140053 1244 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm10284-201ENSMUST00000145057 1005 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm10481-201ENSMUST00000179228 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gapdh-ps15-201ENSMUST00000180966 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm2574-201ENSMUST00000181051 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm3200-201ENSMUST00000181493 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm8825-201ENSMUST00000182565 998 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm4518-201ENSMUST00000182638 718 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm8330-201ENSMUST00000182754 1008 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm4575-201ENSMUST00000182991 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm8709-201ENSMUST00000183230 1012 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm30191-201ENSMUST00000205501 647 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm45144-201ENSMUST00000207473 354 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Stum-205ENSMUST00000211561 1063 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Icam4-202ENSMUST00000215077 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Zfyve21-204ENSMUST00000221375 1265 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ndufb9-201ENSMUST00000022980 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm10293-201ENSMUST00000076317 1002 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm6316-201ENSMUST00000082064 1020 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Exoc6-201ENSMUST00000066439 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Ldb3-208ENSMUST00000228044 1883 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Zfp703-202ENSMUST00000154256 3152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Tsc2-221ENSMUST00000228412 5432 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Vps51-204ENSMUST00000159832 3048 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Spdef-201ENSMUST00000025054 1824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Cbfa2t3-202ENSMUST00000064674 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Gm4353-201ENSMUST00000111755 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Taf4E9QAP7 Nup35-201ENSMUST00000028382 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms