Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9P8

Rdh16f1, RDH16 family member 1, mousemouse

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Length 317 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rdh16f1E9Q9P8 Mindy1-212ENSMUST00000168223 1812 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Casc4-204ENSMUST00000110586 4032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gal3st4-202ENSMUST00000161279 2059 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Med25-210ENSMUST00000208253 3693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Dcaf17-202ENSMUST00000102701 1703 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cgn-203ENSMUST00000153263 2210 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Esco1-203ENSMUST00000115864 2148 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Tnfaip8l1-201ENSMUST00000077788 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Snhg15-203ENSMUST00000134527 675 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Mcub-204ENSMUST00000153506 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26695-201ENSMUST00000180920 1251 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ino80dos-204ENSMUST00000188602 678 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm18246-201ENSMUST00000221023 728 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Fam124a-201ENSMUST00000039064 3558 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gopc-201ENSMUST00000020008 4216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Nsd3-204ENSMUST00000139966 5261 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm9917-201ENSMUST00000180865 5192 ntTSL 3 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Dhx16-201ENSMUST00000025292 3351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Per1-201ENSMUST00000021271 4671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Loxl2-201ENSMUST00000022660 5316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Skor1-202ENSMUST00000116613 3591 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Sacm1l-201ENSMUST00000026270 3558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Fscn1-201ENSMUST00000031565 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Tjp2-201ENSMUST00000099558 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Egr1-201ENSMUST00000064795 4484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Retreg3-202ENSMUST00000107295 3179 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Arhgef1-201ENSMUST00000047873 3212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Oas1b-203ENSMUST00000183291 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Lyrm1-203ENSMUST00000106517 1279 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Rhox2h-201ENSMUST00000115162 779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ggnbp2-213ENSMUST00000172405 2950 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Zfp109-203ENSMUST00000206960 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Piezo1-209ENSMUST00000156333 8219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Piezo1-201ENSMUST00000067252 8216 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Kcnq2-217ENSMUST00000149964 8209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Txndc11-202ENSMUST00000118362 4248 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Gabra4-201ENSMUST00000031121 4108 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Nhlh2-202ENSMUST00000196324 2647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm26666-201ENSMUST00000180763 2461 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Trank1-201ENSMUST00000078626 10520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Rhot1-202ENSMUST00000055056 4260 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ankrd33b-204ENSMUST00000123325 7466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Get4-202ENSMUST00000110878 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 A830052D11Rik-201ENSMUST00000181729 1130 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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Rdh16f1E9Q9P8 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Ly6d-201ENSMUST00000040404 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Cdkn2d-201ENSMUST00000086374 1264 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Slc23a3-201ENSMUST00000027405 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Fbxo27-201ENSMUST00000039998 1946 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Klhl34-201ENSMUST00000087157 1935 ntAPPRIS P1 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Casp8-201ENSMUST00000027189 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Tom1l2-205ENSMUST00000102682 2256 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Vwa8-202ENSMUST00000227255 3406 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Dgki-203ENSMUST00000101532 4596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gm10044-203ENSMUST00000166813 1471 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Gtf2b-201ENSMUST00000029938 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Prelid1-201ENSMUST00000021942 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Palm3-201ENSMUST00000055077 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 Sfxn4-203ENSMUST00000135808 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
Rdh16f1E9Q9P8 4930429H19Rik-201ENSMUST00000205260 1818 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
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