Protein–RNA interactions for Protein: E9Q9K5

Trdn, Triadin, mousemouse

Predictions only

Length 693 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TrdnE9Q9K5 Dnajc27-202ENSMUST00000049584 2934 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 0610010K14Rik-207ENSMUST00000108577 659 ntTSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm11455-201ENSMUST00000149285 733 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Gm23547-201ENSMUST00000158210 271 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Timm9-202ENSMUST00000166120 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Umpk-ps-201ENSMUST00000211897 827 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Tac4-201ENSMUST00000021242 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Timm9-207ENSMUST00000221559 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Timm9-209ENSMUST00000221815 1193 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 CT010506.4-201ENSMUST00000225457 351 ntBASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Rgp1-201ENSMUST00000030190 1292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Batf-201ENSMUST00000040536 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.36
TrdnE9Q9K5 Prmt5-201ENSMUST00000023873 2691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Arid3c-201ENSMUST00000084698 1417 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Tmpo-202ENSMUST00000072239 3533 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Trim3-205ENSMUST00000147044 2972 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ankrd27-202ENSMUST00000186245 1926 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ica1l-201ENSMUST00000027172 3650 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Pak2-201ENSMUST00000023467 5741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm42632-201ENSMUST00000201707 2411 ntBASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Dhx33-202ENSMUST00000108527 5184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Slc12a5-207ENSMUST00000202223 5690 ntTSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Vps26a-202ENSMUST00000105447 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ablim2-205ENSMUST00000114205 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Trp53-206ENSMUST00000171247 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ccer1-201ENSMUST00000060703 1865 ntAPPRIS P1 BASIC17.27■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Cacnb1-201ENSMUST00000017552 3396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Nfkb1-201ENSMUST00000029812 4117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Olfr317-202ENSMUST00000215513 2769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Slc12a5-201ENSMUST00000099092 6028 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ceacam16-201ENSMUST00000014830 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ap4b1-204ENSMUST00000106824 2412 ntTSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 9930021J03Rik-204ENSMUST00000177155 6632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm12008-201ENSMUST00000117791 755 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm15173-201ENSMUST00000122049 433 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Sap25-206ENSMUST00000177466 1005 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Pdcd2l-201ENSMUST00000002710 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Apoa1-201ENSMUST00000034588 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Mtus2-201ENSMUST00000071878 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Mcidas-201ENSMUST00000092089 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ppp1r18-204ENSMUST00000144382 2536 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm20743-201ENSMUST00000191735 1576 ntTSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 1700012B07Rik-202ENSMUST00000106674 2035 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Tigd5-201ENSMUST00000192937 4801 ntAPPRIS P1 BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Rbbp9-201ENSMUST00000028915 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Slc35e2-201ENSMUST00000043829 2910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Chuk-201ENSMUST00000026217 3502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gpr160-207ENSMUST00000166278 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Slc35c2-201ENSMUST00000017808 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Abcb4-201ENSMUST00000003717 4079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.26■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Adarb1-202ENSMUST00000098374 6584 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm26578-201ENSMUST00000181702 4611 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Siglecf-201ENSMUST00000012798 2510 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Eif3f-201ENSMUST00000033342 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Tspan32-204ENSMUST00000105923 1499 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 AC119177.1-201ENSMUST00000227647 1332 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm12462-201ENSMUST00000140826 3056 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Faf1-201ENSMUST00000102724 4468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Dnm1l-201ENSMUST00000023477 4017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Rexo4-202ENSMUST00000114020 2278 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Edem3-204ENSMUST00000191070 3127 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Pemt-203ENSMUST00000102693 961 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Il11ra2-201ENSMUST00000108006 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 H2-Bl-201ENSMUST00000173080 1138 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm20680-201ENSMUST00000176881 789 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 H2-Bl-204ENSMUST00000184502 862 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm45167-201ENSMUST00000208007 322 ntBASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 1110038F14Rik-201ENSMUST00000071792 1010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Grid2-201ENSMUST00000095852 5860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Zfp639-205ENSMUST00000193287 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Zfand3-201ENSMUST00000057897 2617 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Adal-201ENSMUST00000028702 2471 ntTSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Uros-203ENSMUST00000106145 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Ifrd1-201ENSMUST00000001672 3378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.25■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Scara5-202ENSMUST00000069226 3262 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Acat2-203ENSMUST00000159697 1800 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 1700022A21Rik-202ENSMUST00000182910 1448 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Dtd2-201ENSMUST00000021339 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Sipa1l1-202ENSMUST00000166429 8215 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Sez6-202ENSMUST00000093995 4239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Sass6-205ENSMUST00000198311 2404 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 4930556N13Rik-201ENSMUST00000173677 1034 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Flg-204ENSMUST00000178752 756 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Rac3-201ENSMUST00000018156 1076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm10419-203ENSMUST00000197854 653 ntTSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Gm20337-201ENSMUST00000219062 1118 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 5430427M07Rik-202ENSMUST00000221524 1023 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Treml1-204ENSMUST00000224001 1220 ntAPPRIS P2 BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Vcan-205ENSMUST00000159337 2273 ntTSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Las1l-201ENSMUST00000079987 2530 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
TrdnE9Q9K5 Kif26a-201ENSMUST00000128402 6918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.24■□□□□ 0.35
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50 ms