Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7N9

Dnah11, Dynein, axonemal, heavy chain 11, mousemouse

Predictions only

Length 4,488 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnah11E9Q7N9 Krt18-201ENSMUST00000023803 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Apoa5-201ENSMUST00000034584 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Bclaf3-202ENSMUST00000112464 3366 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.51□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 1700029B24Rik-201ENSMUST00000194040 497 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gm4129-201ENSMUST00000220083 625 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Rmdn1-201ENSMUST00000029888 1734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Lpcat2-201ENSMUST00000046290 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ephx3-202ENSMUST00000162117 1590 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gm9115-201ENSMUST00000120192 1348 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Camk2d-221ENSMUST00000171289 2217 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 N6amt1-202ENSMUST00000118115 1951 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Mrps17-202ENSMUST00000118420 843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ube2f-210ENSMUST00000191368 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Fmc1-201ENSMUST00000019833 479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Zfp936-202ENSMUST00000200973 578 ntTSL 3 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Rps11-201ENSMUST00000003521 661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ifnl2-201ENSMUST00000081684 702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Kcnip2-203ENSMUST00000086993 1005 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gm5049-201ENSMUST00000195878 1590 ntBASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 D130052B06Rik-201ENSMUST00000101371 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ngf-202ENSMUST00000106925 1187 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ndufa8-201ENSMUST00000070112 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Cldn9-201ENSMUST00000085989 1435 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Actl7b-201ENSMUST00000095080 1439 ntAPPRIS P1 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 4921504A21Rik-201ENSMUST00000180594 2156 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Dcdc2a-201ENSMUST00000036932 2345 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ank3-223ENSMUST00000182557 1569 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Zfp384-208ENSMUST00000112428 3132 ntTSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Tcf3-206ENSMUST00000105342 2928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ifngr2-201ENSMUST00000023687 3254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Nfkbid-202ENSMUST00000108175 2000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Mri1-203ENSMUST00000126435 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ly6h-207ENSMUST00000163116 2801 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Dmrtc1c1-201ENSMUST00000118218 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Dmrtc1c2-203ENSMUST00000120314 1611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Sec11a-203ENSMUST00000119980 903 ntTSL 2 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Mtmr2-209ENSMUST00000156801 617 ntTSL 5 BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ube2i-211ENSMUST00000173713 890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Coa6-202ENSMUST00000211868 564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ndufc2-201ENSMUST00000032882 683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Prtn3-201ENSMUST00000006679 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Polr3d-202ENSMUST00000180358 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.5□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Fubp3-202ENSMUST00000113482 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ddx20-201ENSMUST00000090680 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Pttg1ip-201ENSMUST00000009435 2294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Cdcp2-202ENSMUST00000221740 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ttc16-202ENSMUST00000091059 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Rcn2-201ENSMUST00000114276 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Sec22b-203ENSMUST00000130620 640 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gm10766-202ENSMUST00000194123 606 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Rwdd2b-201ENSMUST00000039101 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Atxn7l3-201ENSMUST00000073234 3688 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Zfp316-201ENSMUST00000051665 3054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Phf8-204ENSMUST00000112666 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Itpripl1-201ENSMUST00000110386 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Cyp2d11-201ENSMUST00000170255 1590 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Asic1-205ENSMUST00000228185 1818 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Trav13-3-201ENSMUST00000117226 336 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 AC099934.3-201ENSMUST00000223192 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Jakmip1-212ENSMUST00000174629 1941 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Mthfsd-202ENSMUST00000116415 1520 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Cyp2a5-201ENSMUST00000005685 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Htr3a-202ENSMUST00000217289 1987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Mindy4-203ENSMUST00000204842 2211 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 4930429P21Rik-202ENSMUST00000194547 2061 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Clstn1-201ENSMUST00000039144 3319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Lrrfip2-201ENSMUST00000035078 3260 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ube2j2-206ENSMUST00000118192 922 ntTSL 5 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Rnd1-203ENSMUST00000120997 856 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gm13496-201ENSMUST00000141133 1165 ntTSL 2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Meg3-208ENSMUST00000143847 706 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gm17150-201ENSMUST00000165577 381 ntBASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gm10142-201ENSMUST00000179767 363 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 9230114J08Rik-201ENSMUST00000200375 350 ntTSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 2310016G11Rik-202ENSMUST00000209111 733 ntTSL 3 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ufsp1-201ENSMUST00000052825 1037 ntAPPRIS P1 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ptpn6-202ENSMUST00000112484 2219 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gcnt2-205ENSMUST00000225759 1366 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Camkv-201ENSMUST00000035700 3277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Cables1-202ENSMUST00000171109 3396 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Rab33b-201ENSMUST00000054387 3492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Pik3ap1-201ENSMUST00000059672 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.49□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Cend1-202ENSMUST00000124444 1733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Ap4e1-203ENSMUST00000110394 2271 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Nxf1-202ENSMUST00000010248 748 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Pax5-213ENSMUST00000173821 996 ntTSL 5 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Rhox9-201ENSMUST00000089062 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Tubgcp4-202ENSMUST00000110657 1992 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Nap1l4-206ENSMUST00000208190 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 AI606473-201ENSMUST00000177201 1731 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Akap1-201ENSMUST00000018572 3758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Efs-202ENSMUST00000227037 2540 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 Gm13066-201ENSMUST00000145263 884 ntTSL 1 (best) BASIC9.48□□□□□ -0.89
Dnah11E9Q7N9 4930449I04Rik-201ENSMUST00000198191 1123 ntBASIC9.48□□□□□ -0.89
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.5 ms