Protein–RNA interactions for Protein: E9Q7L1

Urb2, URB2 ribosome biogenesis 2 homolog (S. cerevisiae), mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,524 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Urb2E9Q7L1 Pax8-201ENSMUST00000028355 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Zmynd19-201ENSMUST00000028350 3903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Rnf170-209ENSMUST00000209300 1881 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Mcrs1-202ENSMUST00000163506 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Vax2os-201ENSMUST00000123402 1435 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 A830012C17Rik-201ENSMUST00000131498 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm42473-201ENSMUST00000201056 2291 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Rps2-ps9-201ENSMUST00000121414 817 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Grp-202ENSMUST00000173530 617 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Neat1-203ENSMUST00000174829 1030 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Pspn-201ENSMUST00000002740 474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm8973-201ENSMUST00000079818 315 ntAPPRIS P1 BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Mpl-203ENSMUST00000106375 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Cabp4-201ENSMUST00000025761 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Plekhb1-206ENSMUST00000107047 1926 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Alox8-202ENSMUST00000094078 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Srp68-202ENSMUST00000106425 2330 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Ccdc103-201ENSMUST00000021307 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm45723-201ENSMUST00000212135 1783 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Chst14-202ENSMUST00000110837 1991 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm5187-201ENSMUST00000117317 991 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Snap47-202ENSMUST00000120940 1192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm9299-201ENSMUST00000206392 1140 ntBASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Cyp46a1-201ENSMUST00000021684 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Dbndd1-201ENSMUST00000176155 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Bckdha-201ENSMUST00000071329 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 B4galt2-203ENSMUST00000106421 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Slc41a3-202ENSMUST00000044019 2412 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Bicdl1-201ENSMUST00000055408 3026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Tmem53-202ENSMUST00000106433 913 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Glrx2-202ENSMUST00000111957 580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 1700120C18Rik-201ENSMUST00000182952 985 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Txn1-201ENSMUST00000030051 1051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Eci2-211ENSMUST00000171229 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Fbrsl1-201ENSMUST00000056124 2700 ntTSL 2 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Card9-202ENSMUST00000100303 1947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm42690-201ENSMUST00000197921 1836 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Adck5-207ENSMUST00000160784 1998 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Cryge-202ENSMUST00000161960 690 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 CU024892.2-201ENSMUST00000224608 832 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Duoxa1-201ENSMUST00000028653 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 A230072E10Rik-203ENSMUST00000175942 2940 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Dctd-203ENSMUST00000170263 2096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Eif2b1-201ENSMUST00000031334 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Trip6-201ENSMUST00000024119 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 9530085L11Rik-201ENSMUST00000203963 2115 ntBASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Sphk1-204ENSMUST00000106386 1879 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gmcl1-201ENSMUST00000001185 2949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Pmepa1os-201ENSMUST00000150185 680 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 U2af1l4-216ENSMUST00000166510 835 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm27243-201ENSMUST00000183964 521 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Rad51d-202ENSMUST00000021033 1201 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Cryba4-201ENSMUST00000086629 746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Mfsd6-205ENSMUST00000156876 4932 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Ghdc-201ENSMUST00000017891 2462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm26761-201ENSMUST00000180650 2192 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Zbtb32-201ENSMUST00000108150 854 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm42442-201ENSMUST00000197951 1133 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm18056-201ENSMUST00000207670 568 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm18061-201ENSMUST00000208350 562 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm18063-201ENSMUST00000208529 568 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm18052-201ENSMUST00000208750 559 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 B230118H07Rik-202ENSMUST00000099682 895 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Kifc3-212ENSMUST00000213004 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gnb1-201ENSMUST00000030940 3131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Malsu1-203ENSMUST00000128616 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Pdlim7-201ENSMUST00000046246 1697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Ccnc-203ENSMUST00000108240 1406 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Urb2E9Q7L1 Cabp5-202ENSMUST00000117400 1258 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm14508-201ENSMUST00000127049 901 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm45505-201ENSMUST00000210252 948 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 AC155258.1-201ENSMUST00000219303 253 ntBASIC23.58■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 AC165254.1-201ENSMUST00000220736 599 ntTSL 5 BASIC23.58■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Hsf4-206ENSMUST00000173859 1576 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Cyp2ab1-201ENSMUST00000023513 2720 ntTSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Ifi47-204ENSMUST00000213728 1678 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm20646-201ENSMUST00000176807 1316 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Dctn4-202ENSMUST00000223590 1530 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Prmt6-203ENSMUST00000190378 3051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm10327-201ENSMUST00000105222 1002 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm8749-201ENSMUST00000117737 331 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Oprm1-229ENSMUST00000152674 1179 ntTSL 3 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Tldc2-202ENSMUST00000166140 639 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Urb2E9Q7L1 Gm17795-201ENSMUST00000214505 757 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.3 ms