Protein–RNA interactions for Protein: E9Q548

Gm20518, Predicted gene 20518, mousemouse

Predictions only

Length 580 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gm20518E9Q548 Xylt2-201ENSMUST00000116349 3442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Ddc-210ENSMUST00000178704 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Arhgap44-201ENSMUST00000047463 4074 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.8□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Ano10-201ENSMUST00000042546 2653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gm26793-201ENSMUST00000180930 2732 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Ambra1-205ENSMUST00000111317 4929 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Frmd4b-203ENSMUST00000113355 4913 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Tada3-201ENSMUST00000032410 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Ppef2-201ENSMUST00000031359 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Nrxn1-204ENSMUST00000159778 3414 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Aatk-202ENSMUST00000103019 5177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 2210011K15Rik-201ENSMUST00000190690 1741 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Dpysl3-204ENSMUST00000121805 5484 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Ube2d3-210ENSMUST00000197539 2515 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gpr135-201ENSMUST00000050649 3150 ntAPPRIS P1 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Slc38a6-204ENSMUST00000126488 589 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Senp1-204ENSMUST00000180657 3806 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gm43935-201ENSMUST00000203569 1050 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Rpl19-ps10-201ENSMUST00000205555 330 ntBASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gm40849-201ENSMUST00000222330 603 ntTSL 3 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 2300002M23Rik-201ENSMUST00000044326 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Rpl30-202ENSMUST00000079735 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Eva1c-203ENSMUST00000099548 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 4921511I17Rik-201ENSMUST00000220545 1341 ntTSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gm34419-201ENSMUST00000211383 1387 ntTSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Susd6-201ENSMUST00000068519 4977 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Klrg1-201ENSMUST00000032207 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Prnp-201ENSMUST00000091288 2184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Bsx-201ENSMUST00000067375 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Csnk2a2-201ENSMUST00000056919 3773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Shmt2-201ENSMUST00000026470 2289 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Bptf-201ENSMUST00000057892 11488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.79□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Zfp90-201ENSMUST00000034382 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Tbx3os1-206ENSMUST00000202307 1787 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Rgs20-201ENSMUST00000002533 1778 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gm2788-204ENSMUST00000209288 1966 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gm3739-201ENSMUST00000165744 2011 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Casc4-201ENSMUST00000078752 4215 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Sox1ot-202ENSMUST00000186174 7420 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Ttc13-210ENSMUST00000214828 3301 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Cpne6-201ENSMUST00000074225 2201 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Fgf5-201ENSMUST00000031280 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Rnf38-202ENSMUST00000098098 5061 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Ptpa-208ENSMUST00000131476 989 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Znhit1-206ENSMUST00000156963 1208 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Sssca1-203ENSMUST00000159693 705 ntTSL 3 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Cyhr1-204ENSMUST00000177359 1110 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gm44107-201ENSMUST00000203242 573 ntTSL 2 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 AC131709.1-201ENSMUST00000224731 1180 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 CT009510.1-201ENSMUST00000227972 270 ntBASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Bpifa3-201ENSMUST00000028984 1107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Igflr1-201ENSMUST00000043850 1186 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Idnk-201ENSMUST00000051490 764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Hs3st3a1-201ENSMUST00000058652 3939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Lancl1-203ENSMUST00000119559 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Tmem185b-202ENSMUST00000183952 2824 ntAPPRIS P1 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Gm39027-201ENSMUST00000208560 2942 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 H2-T23-201ENSMUST00000102678 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Morc4-201ENSMUST00000033811 4412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Terf1-201ENSMUST00000027057 1581 ntTSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Fam178b-201ENSMUST00000114981 1659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Arhgef9-217ENSMUST00000197364 1796 ntTSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Fam8a1-201ENSMUST00000099547 3664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Bcl2l14-206ENSMUST00000163589 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Rspo4-201ENSMUST00000042217 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Pogk-204ENSMUST00000135673 2433 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.78□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Klhl12-202ENSMUST00000112232 3220 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Dzip3-201ENSMUST00000114516 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Hcfc2-201ENSMUST00000020478 3422 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Zfp36l2-201ENSMUST00000060366 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Frmd5-207ENSMUST00000138157 4230 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.2
Gm20518E9Q548 Slc24a3-202ENSMUST00000110007 4048 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Nxnl1-202ENSMUST00000163659 2730 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cbln3-202ENSMUST00000172378 1438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Traf7-210ENSMUST00000176353 2503 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Abi2-206ENSMUST00000188594 1658 ntTSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm8242-201ENSMUST00000193029 1420 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Zfp524-203ENSMUST00000209030 1128 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 5033428I22Rik-203ENSMUST00000210614 952 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Krt2-201ENSMUST00000023712 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Ndufv2-201ENSMUST00000024909 927 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tgfa-201ENSMUST00000032066 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Fbxl18-201ENSMUST00000035985 2831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cmtm8-201ENSMUST00000047013 1064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Tmem88-201ENSMUST00000050140 1582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Selenov-201ENSMUST00000056589 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sfxn5-202ENSMUST00000059034 1081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Rexo4-201ENSMUST00000064244 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Cdpf1-201ENSMUST00000071876 997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sgcd-201ENSMUST00000077221 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Lrp4-201ENSMUST00000028689 7926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Gm37305-201ENSMUST00000195714 4279 ntBASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Edem3-202ENSMUST00000187951 3115 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sybu-207ENSMUST00000227305 3124 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Unc5d-202ENSMUST00000209401 3081 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Unc5d-203ENSMUST00000210298 3060 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Unc5d-205ENSMUST00000211448 3087 ntTSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Gm20518E9Q548 Sec14l1-201ENSMUST00000021177 2866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.77□□□□□ -0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms